第壹話?基爾獸誕生，我心目中的數碼寶貝?
對他來說，與朋友玩數碼暴龍的Card?Game及在上課時偷偷地把自己創作的數碼暴龍畫在筆記簿上是最大的樂趣！那個就和某個地方的十分熱愛數碼暴龍的少年壹樣的啟人，他竟在某日偶然得到了壹樣能把他的命運大大改變的神秘對象，那就是以往從未有人見過的不思議的藍色的卡片藍卡！?
就在把藍卡放在讀卡機讀進去的瞬間，在啟人的眼前冒險之門已經打開了。接著到訪的是，與命運的拍檔．基爾獸的相遇。?
第二話?妳是我的好朋友，大耳獸出場?
因為藍色的卡片的力量而變形的讀卡機，在畫面上顯示出裂開了的數碼蛋。之後從天空降下光柱。啟人在心中有種確實的預感所以便前往光柱。在那裏等待著啟人的是，啟人所想象出來的數碼暴龍．基爾獸。?
啟人因為壹想象不到的光景而不由得嚇得站不起來。基爾獸吐出來的火焰竟把混凝土的墻壁開了個洞！跟著的壹剎那啟人所看到的是……基爾獸天真無邪地向他笑。?
第三話?妖狐獸對決基爾獸，戰鬥是數碼暴龍的宿命?
多虧基爾獸而令到啟人的學校陷入大恐慌！啟人也因為被人說沒資格做馴獸師而受到傷害及信心盡失，但最後也被基爾獸的天真無邪所救回，啟人及基爾獸壹邊跨越困難及壹邊逐步逐步地成為真正的朋友。但是在那2人面前竟發生了……?
基爾獸受到突然的攻擊，及被打飛至鐵絲網！襲擊啟人他們的就是妖狐獸及它的拍檔留姬。留姬單方面向啟人宣戰，雖然啟人不允許戰鬥，但基爾獸竟無視啟人的說話開始向妖狐獸反擊！?
第四話?馴獸師的試煉，打倒金剛獸?
留姬向啟人單方面宣戰，李健良加入阻止2人的戰鬥，卷入戰鬥的大耳獸因受到攻擊的沖擊而進化成加魯哥獸。失去理性的加魯哥獸不斷亂槍掃射，就連李健良也不能制止。而那個槍口正向著留姬對準，就在這千鈞壹發的瞬間……?
基爾獸緊急地撲向加魯哥獸而救了留姬。雖然並沒有發生危險的事情，但李健良的表情卻很生硬。與啟人天真無邪地憧憬進化相對照，李健良不允許大耳獸再次進化。?
第五話?咕嚕咕嚕，和古樂獸壹起玩吧?
李健良不斷拒絕進化的理由是因為進化後的大耳獸變得暴走，以及與自身的創傷的過去有關。不準進化的大耳獸不斷受到金剛獸強力的攻擊，但是引發李健良壹瞬轉機的CARD?SLASH呼喚出逆轉！不用進化，2人單靠互相合作克服了危機的模樣，讓啟人學習了壹樣作為馴獸師的重要東西。?
不過在接著的星期日，犯人意外地弄清楚了。因要到白兔小屋值班而來到學校的啟人，在操場的壹角偶然找到的是……古樂獸！?
第六話?夥伴的真意，妖狐獸進化?
在晚上到學校玩耍的基爾獸及古樂獸的面前邪魔獸實體化了。與邪魔獸細小的身體不成比例的強力的攻擊令基爾獸他們很痛苦，而拯救了這個危機的就是留姬以及她的拍檔妖狐獸。?
留姬的學校的上課參觀日。為了發泄對在上課中途早退了的母親的不滿，留姬歡喜地走入那偶然找到的數碼領域。?
第七話?基爾獸陷入危機，地底冒險記?
曾經在無數的候補中被選為留姬的拍檔，妖狐獸誓要成為最強的數碼暴龍。但是對無論怎麽戰鬥也不能進化的妖狐獸，留姬的焦燥也越來越厲害。就在這時候初次的危機襲擊2人，犧牲自己去守護留姬的妖狐獸的姿態大大動搖留姬的心。然後就在2人的心相通的瞬間，妖狐獸出色地實現了九尾狐獸的進化。?
第八話?基爾獸進化，西新宿大決戰?
雖然受到沖擊但啟人仍相信數碼器連系著兩人，並出發去拯救基爾獸。而啟人的這模樣也深深地打動李健良及留姬的心並開始協力。初次合力的3人，在異空間出色地成功救出基爾獸。就這樣看來啟人與基爾獸應該會更加緊密的互相連系，但是……?
第九話?變回基爾獸，古拉獸的減肥計劃?
以驚嚇情侶為樂的真正犯人原來是小妖獸。啟人對自己懷疑基爾獸感到羞愧，看到在戰鬥中被弄得慘不忍睹的基爾獸終落下淚來。而回答這情感的是基爾獸進化成古拉獸，把強敵邪龍獸出色地打倒了。但是……?
第十話?妖狐獸是朋友嗎？留姬的疑惑?
啟人為了令古拉獸變回基爾獸而進行大奮鬥。雖然想出來的作戰及特訓怎也沒有，但啟人拚命的情感終於感動了上天，令古拉獸平安地變回基爾獸。但今次的事件也衍生出新的疑問。數碼寶貝的進化到底是什麽回事……?
數碼寶貝的進化是什麽回事？留姬比別人更在意這個疑問。完全沒有累積經驗，也沒有讀取其它數碼寶貝數據的基爾獸也可進化，留姬怎也不能理解。?
第十壹話?新宿陸橋下，1分30秒的對決?
冰惡魔獸的魔爪正俏俏地靠近開始抱有疑問的留姬。為了令留姬成為其柏檔，冰惡魔獸驕傲地展示那些過去打敗過的數碼暴龍的標本。過去的自己就如冰惡魔獸般只追求強勁，留姬受到不少的沖擊。雖然因妖狐獸及啟人的活躍而得救了，但是留姬卻不能整理其心情，不理會妖狐獸地獨自走了……?
第十二話?留姬與妖狐獸的關系危機?
另壹方面已經1人的馴獸師留姬，依然不能整理其心情。即使分離也始終擔心妖狐獸的事。盡管知道只要叫壹聲妖狐獸便會回到她身邊，但始終不能開口。?
妖狐獸也壹樣抱著不能幹脆解決此事的情感。為了埋沒失去留姬的空白，妖狐獸不斷重復那些證明自己強勁的戰鬥。但是留姬所看見的這個妖狐獸的模樣卻是，1人戰鬥的妖狐獸已不需要自己，再次不理它了。?
第十三話?數碼寶貝逮捕令，不祥的預兆?
與留姬訣別後的妖狐獸繼續著只有自己1人力量的孤獨戰鬥。雖然留姬很擔心妖狐獸，但認為妖狐獸已不需要自己所以就不理它。?
乘著那壹瞬間的空隙鳥人獸作出突然的反擊。留姬完全沒有考慮會被鳥人獸攻擊到的危險奮身撲出去，妖狐獸也進化來回應這情感！跨越這危機後的留姬及妖狐獸相互的心情終變得有多少坦率，再次開始步向拍擋之路了……?
現在，禁斷的大門快被打開了……?
第十四話?馴獸師們站起來，大古拉獸超進化?
在夜空中冒起的藍色旋渦。全部在網絡上存在的數碼寶貝也被卷入，完全地把數據分解的狂暴之牙……殲滅計劃。山木滿足地仰望著殲滅計劃把所有有意識的數碼寶貝壹壹排除。雖然不能接受山木那對所有數碼寶貝都有敵意的做法，但啟人只能仰望著那些不斷被卷入旋渦而失去性命的光芒。但是就在這時，任何人也預測不到的事態發生了。旋渦的中心出現了巨大的柱！?
第十五話?巨蛇獸出現，大江戶線大混亂?
要把數碼暴龍消去的殲滅計劃，諷刺的是結果卻把數碼寶貝來到現實世界的通道打開了。出現了的強敵飛虎獸壓倒性的力量，先後把九尾狐獸及加魯哥獸擊敗。然後就在飛虎獸的攻擊古拉獸的瞬間，在啟人的身體內劇痛亂竄！那正是大基爾獸的痛楚。***有痛楚的事實令啟人重新覺悟作為馴獸師的使命，在藍卡的力量下大基爾獸得以進化成大古拉獸，戰勝了飛虎獸……?
啟人成功的進化成完全體，把飛虎獸打倒了。但這並沒有完全解決問題。為了要從現實世界鬧事的數碼寶貝中守護人們，啟人、李健良及留姬這3人決心組成壹個隊伍。?
第十六話?守護城市的燈火，危險的露營?
為了對抗在現實世界鬧事的數碼寶貝，啟人他們組成馴獸師隊伍。但當要實行時步伐總是不能壹致……事情是啟人巡邏的邀請給李健良及留姬拒絕了。然後就在數碼寶貝出現時，啟人這次卻沈迷在遊戲中而聯絡不到。就在馴獸師迎接了冷不防的危急關頭時，因小妖獸意外的幫助而得以成功匯合。雖然很危險但也獲得了初次的勝利。?
第十七話?尋找藍卡，拉比獸電光火石?
想把大耳獸帶到自然之中休息。阿健把那拿不定主意的新敵人．真達羅獸的出現看漏了。但是鐵雞獸卻在壹夜之間把全城的電力吃光，強大地成長起來了。健良對自己的失誤不斷自責。為了保護李健良，啟人鼓勵他。2人同心合力地與鐵雞獸戰鬥，誓要守護和平的露營。藍卡的光輝將會把戰鬥引導往超速的世界……?
第十八話?美麗的進化，飛舞在月光下，祭師獸?
在尋找藍卡的謎的阿健他們的面前出現了強敵白羊獸和蠻牛獸。面對加魯哥獸的危機，健良抽換迷惘SLASH那張藍卡。加魯哥獸進化成完全體拉比獸，以驚異的速度作為武器，擊破它們兩個。?
戰鬥結束後，健良從父親．鎮宇口中得知了數碼暴龍誕生的秘密。不過就在同壹時間，該已被打倒的伐折羅獸接觸了留姬及妖狐獸。伐折羅獸指示妖狐獸要與它壹起走。妖狐獸接受了邀請，留下“也有些事只有數碼暴龍才會知道”的這句話後便和伐折羅獸壹起在夜晚的黑暗中消失了……今晚，在月光沐浴的美麗戰士要誕生了……?
第十九話?我要變強大，小妖獸力爭上遊?
妖狐獸與蠻牛獸壹起消失了。留姬等了很久妖狐獸也不回來，感到很不安。但是妖狐獸的真正用意是為了知道帝魔的目的。不為了數碼寶貝之神，而選擇了與留姬壹起依自己的意誌生活的妖狐獸，終於進化成完全體祭師獸，打倒了蠻牛獸，與留姬的關系更加密切了……?
直覺上被人罵作蠢才，小妖獸便沖入剛發生的數碼領域。在那裏等待著小妖獸的是新的帝魔------戰馬獸。戰馬獸從容的俯視著逞強的小妖獸，最後突然說出了壹句帶有沖擊性的說話。小妖獸也與其它的數碼寶貝同夥，終歸是人類所飼養的數碼寶貝……?
第二十話?最後的王牌，友誼藍卡?
拒絕妖狐獸他們的幫助，投身了孤單壹人的無謀戰鬥。因抱著我想變強的想法而令小妖獸抵得住戰馬獸的攻擊，即使腳步不穩也繼續站起來。然後就在絕望的狀況中，小妖獸終於睹上壹切作出了最後的攻擊……?
小妖獸賭上壹切的突擊。但仍不能令戰馬獸受到任何傷害。就在小妖獸終於用盡力量快要被戰馬獸讀取的時候……由都庁發射出來的波動捉住了戰馬獸！?
最後的希望是自制的藍卡！博和、啟人的情感會傳達到基爾獸嗎？創造奇跡吧，友情的CARD?SLASH！?
第二十壹話?樹莉的夥伴數碼暴龍是獅子獸？?
樹莉為了成為馴獸師而向留姬請教了卡的使用方法。之後，獅子獸這數碼寶貝就在樹莉的眼前實體化了。樹莉堅決相信這壹只獅子獸就是自己的拍檔數碼寶貝……?
第二十二話?野豬獸登場，保衛我們的家園?
西新宿壹帶發生了地震。啟人及健良也有壹種討厭的預感。?
基爾獸感到有數碼寶貝！突然噴出壹團霧，把每個公寓區全部包圍起來了。人們在抱怨。在濃霧消散後卻出現了壹只十分巨大的數碼暴龍！它就是野豬獸。基爾獸它們即使進化來應戰也不是對手。野豬獸壹邊破壞明治通道壹邊前進。?
山木打算使用殲滅計劃。但因那些在那裏的小朋友可能也會被卷入，所以鎮宇反對。不過除此之外便再沒有其它方法了……?
第二十三話?數碼寶貝總出擊，迎風前進?
殲滅計劃起動了！不過就連完全體們也敵不過。留姬也不知該用哪張卡，而健良則認為卡內有著自己所相信的力量，若果相信便可把力量經數碼器傳達。?
得到了卡的力量的祭師獸及拉比獸形勢逆轉。但是，數碼寶貝們仍感到力量便抽走。正因為山木的殲滅計劃起動了。?
另壹方面，靈猴獸原來是帝魔的壹員，靈猴獸取出寶玉，扔進了殲滅計劃。就在殲滅計劃要悲慘的崩潰時，山木獨自留下。?
第二十四話?前進，數碼寶貝世界?
數碼世界的出現，令到現實世界陷入大混亂。數碼寶貝的災害也成了國家的重大問題。山木看見這些新聞感到很失落。不過，麗花開導他說“有些事只有妳才能做到”。在絕望的深淵中苦惱的他的答復是……?
啟人他們為了解決這個事態，決心出發往數碼世界。他們各自向家人介紹了自己的數碼暴龍後，傳達了將會在明日踏上旅程。?
第二十五話?再見，我的家?
啟人他們進入了數碼寶貝世界及其地帶之中！壹個用雙筒望遠鏡便可看見壹個反轉的日本地圖的世界！好不容易才到達的地方竟是壹望無際的荒野。啟人在那裏豎立了壹支旗。首先要找找看有沒有人造的東西，用望遠鏡看見了壹條類似天線的物體，便以此為目標步行。但這只是壹堆巖石。而且那裏還有野生數碼寶貝的攻擊！?
第二十六話?強風谷的公公獸和婆婆獸?
留姬、博和及健太被光吹飛了。不省人事、醒來後，看見現實世界球變得很細小。已經被吹飛到很遠了。?
附近有壹些民房，但沒有門及窗，屋蓋低低的圓圓的。看著應該是為了對抗強風而設的。風又刮起，各式各樣的東西被吹起，撞向房子。結果他們再次被吹飛，三人飛到了公公獸及婆婆獸這對夫婦所住的房子。就在大家把因強風而弄歪的門壁弄好時，公公獸及婆婆獸的大戰開始了……?
第二十七話?小妖獸進化，可怕的魔王墮天地獄獸?
啟人他們在找尋留姬等人，但哪裏也找不到。就在這時，大耳獸發現了壹個泥人獸的村落。?
另壹方面小妖獸到了壹個濃霧的世界。在那裏出現了犬神獸，尋找想變強的人。雖然小妖獸齒口否認，但其實內心是很想的。犬神獸向小妖獸發放壹道光，在那裏有拍檔2個小朋友……?
在村落那裏巨大的電單車又再次開始襲擊泥人獸它們了。?
第二十八話?是敵是友，傳說中的馴獸師秋山遼?
留姬、博和、健太及妖狐獸在旗那裏等待，但總是沒人回來。留姬於是遺下博和及健太，走去找尋其它同伴。被遺下的2人感到不安，所以也追上留姬了。?
另壹方面，啟人他們覺得留姬他們說不定會在旗那裏等候，所以回來。不過那裏已經沒人。但是基爾獸嗅到了妖狐獸的氣味。?
第二十九話?幽靈古堡，古樂獸遇險記?
啟人他們來到了壹個扭曲了的單色世界。人數又回復到先前那樣。喜歡Card?Game的啟人能與憧憬的遼相會而感動。另壹方面因留姬為了什麽，而獨自留在齒輪的世界。啟人他們先要做的是在這單色的世界等待她。?
啟人他們發現乘著飛龍獸的靈猴獸！雖不知道古樂獸是否在那裏，但也追著它去……?
第三十話?古樂獸來自數碼世界的緊急呼救?
啟人他們頭頂的現實世界球發出光輝，光之柱便縱橫不斷的亂走起來，啟人他們得找個地方閃避。在現實世界的山木的計算機收到了壹封由啟人寄出的E-mail，寫著“我們大家都很好”，竟是從數碼世界傳來的E-mail！至於走散了的留姬與妖狐獸。數碼精靈突然出現，並拉著留姬到壹條小河。在留姬被激流沖走時拋出樹枝拯救她的竟是…古樂獸！基爾獸嗅到古樂獸的氣味。在壹片沙塵滾滾後，留姬、妖狐獸及古樂獸出現，他們終於再會了。可是他們並不知道該怎麽返回現實世界。啟人他們迷惘時，九尾狐獸察覺到墮天地獄獸的正體就是小妖獸，但墮天地獄獸卻否定。現實世界正進行殲滅計劃的測試，不知為何殲滅計劃竟不能停止！?
第三十壹話?與守衛獸的友情，博和也成為馴獸師了?
突然所站的地方液體化，健太、博和、樹莉、留姬、妖狐獸及基爾獸都跌下去，降落到壹個小世界古事記。留姬他們的出現，令安杜路獸提高警戒。?
第三十二話?基爾獸誕生之迷，神秘的水底世界?
啟人他們到達了水中。在陽光刺眼的藍天下，黑色外表的MIB也在。?
啟人他們怎麽樣也不能脫身。當看熒光幕時發現山木傳來的E-Mail，寫著“沒事便最好了。祈望奮勇戰鬥”。在眾人的父母面前山木出現，從計算機可看到啟人傳來的E-mail！向父母問好。Send?E-mail的機器被水弄濕了竟也能動。這裏的水根本不是真正的水。今次，潛入水中也沒濕！成功了！?被指導的出口在強行通過時竟有觸電的感覺。壹行人出了出口後好不容易才走到水之宇宙。在那裏數碼精靈不斷輪流飛舞。相信該是閱覽室的地方浮著壹艘與巨大的D-Ark很相似的物體。在那裏有壹位不思義的男人．水野，開始說出壹件不思議的事情……?
第三十三話?小春也到數碼世界了?
小春因大耳獸的不在而感到寂寞。當在公園遊玩時，落入了突然出現的地帶。在那裏有壹只很大“兔子”的數碼暴龍。另壹方面，乘著交通工具在水世界移動的啟人他們，大耳獸聽到小春的聲音。啟人他們降落到數碼世界。?
第三十四話?溫柔的勇者，獅子獸之死?
變成究極體的墮天地獄獸，要實踐與帝魔的約定，到來打倒基爾獸他們。拉比獸拚命的攻擊對墮天地獄獸來說就像蚊叮壹樣。然後那槍口對準著啟人他們。啟人用盡全身氣力呼叫“基爾獸——”。啟人的聲音到達遠處的古拉獸，是由那道光柱傳來的！古拉獸毫不猶豫地跳進去了……?
因憤怒而忘我的啟人為了進化，壹道閃光突然出現，就像啟人那巨大的分身，滅世龍獸出現了，不斷地向墮天地獄獸攻擊。?
第三十五話?紅蓮騎士獸，真正的究極進化?
古拉獸進化成究極體了！不過，那巨大的猛獸模樣，完全超乎啟人的想象。全因獅子獸被殺，那憤怒而驅使的進化……這異常進化的究極體滅世龍獸，已經聽不進啟人的聲音了。?
那力量令大地裂開，附近壹帶也被波及，那力量竟淩駕於墮天地獄獸，它的存在就只是要不斷進食。就連犬神獸也感受到那力量的沖突正威脅這個世界。就在從旁幹涉時，竟被墮天地獄獸量子分解而被吸收了。?
第三十六話?紅蓮騎士獸對決墮天地獄獸?
基爾獸真正的究極體．紅蓮騎士獸誕生了！?
那就是基爾獸與啟人壹體化後的騎士姿態。?
紅蓮騎士獸與墮天地獄獸展開激戰！！兩只究極體熾烈的戰鬥展開了。?
在這機會下，朱雀獸向靈猴獸下命令，把那個雖是帝魔，卻成為了啟人等人的同伴的黑大耳獸打倒。?
第三十七話?對決朱雀獸，撒多格杜獸進化?
從南大門起，無數拱形的門壹直線伸延至遙遠的彼方。啟人他們留下博和、健太、守衛獸及小春，向朱雀獸的居所朱雀門前去。?
感受到朱雀門內駭人的「憤怒」，基爾獸露出銳齒呻吟，九尾狐獸的毛全部豎起。伴著像大地震的振動，巨大的鳥型數碼寶貝那巨大的身影出現了。它就是四聖獸．朱雀獸。它龐大的身軀令眾人啞然。對於要取回古樂獸的啟人他們來說，古樂獸本來就是這地方的東西。?
轉為啟人攻擊，但對巨大的朱雀獸而言卻絲毫不動。相反朱雀獸的壹擊便把眾人吹飛了。朱雀獸的火，不僅數碼寶貝，連留姬他們也壹並攻擊。眾數碼報備以自身為盾堅決保護眾小朋友。大古拉獸及祭師獸因受到損傷而站不起來，而拉比獸也傷痕累累地勉強站起來強抗！?
第三十八話?真正的敵人出動，四聖獸之戰?
撒多格杜獸的攻擊也不行，赤紅的光從瓦礫的山的內部向四方發放，朱雀獸以不死鳥的姿態再度出現。眾人對於他的不死身啞口無言，但也得繼續戰鬥。竭盡全力進化並再度出擊，勉強地支撐著。不過已經再沒有辦法了。此時上空的厚雲發光，雷像矛般飛射，並於某處落下。從雲中出現的是，巨大的，非常巨大的青色的龍，四聖獸．青龍獸。?
啟人他們從青龍獸口中得知了壹件震驚的事實……?
－白虎門－?
那是壹個山水畫的世界。機械龍獸抱著阿遼，飛跳到瀑布旁的巖石。科學飛龍獸感受到非常強大的氣息，於是便向那裏前去。那裏有四聖獸的壹員．玄武獸。玄武獸為四聖獸白虎獸而留守在這裏。而科學飛龍獸所感受到的強烈氣息並不是玄武獸，而是從背後的谷底所發出的。白虎獸該是在和什麽東西進行熾烈的戰鬥。谷底好像有什麽來路不明的東西開始行動。?
第三十九話?飛舞的究極之光，沙古牙獸?
真正敵人原來是消除數碼暴龍的程序．帝厲魔(D-Reaper)。垃圾是理所當然的，但接著連數碼暴龍也會被消去。四聖獸加強警戒。另壹方面悲痛欲絕的樹莉，始終沒法忘掉失去獅子獸的悲傷。啟人他們對於如何與帝厲魔(D-Reaper)戰鬥感到苦惱。帝厲魔(D-Reaper)為了得到進化的力量而侵略數碼世界，那力量之源就是古樂獸！要快些拯救古樂獸才行！那裏已經有人乘著數碼寶貝來了。他就是乘著科學飛龍獸的秋山遼。?
第四十話?進化之光，爆裂進化?
啟人他們得到四聖獸強力的幫助，終於救出古樂獸！！不過，帝厲魔(D-Reaper)的泡刮到空中，眾人再次籠罩在緊張之中。真正的敵人全力攻進來了。?
下定決心的四聖獸圍著古樂獸的四周，古樂獸的身體也急速上升。然後古樂獸進入暝想，它額上的三角標記開始發出金色的光輝！！接著很多數碼精靈從四周集結，化成光之女神的姿態，把古樂獸抱於胸中。光輝不斷增強，在女神腕中的古樂獸要變回本來的姿態……。?
另壹方面在新宿，山木他們利用Hypnos想把啟人他們送返現實世界，壹直在準備。山木發E-mail至啟人的通信機，叫他們乘坐Ark(方舟)返回現實世界。若然找到Ark的光之軌道的落點，啟人他們便能返回現實世界了。?
第四十壹話?回到現實世界?
阿健的父親他們得到了世界各地的人們的幫助，終於成功送出方舟．Ark，並出現在數碼世界中的啟人他們的面前。已經沒有時間了。為了返回現實世界，啟人他們怱忙地乘上Ark，但是仍看不見留姬及妖狐獸的身影。留姬他們找小妖獸去了。?
Ark低沈地說要升高壹點，於是便開始上升。為了搜尋還沒回來的留姬，阿遼及科學飛龍獸便飛了出去。軌道繪出弧線，壹直伸延至現實世界球體。還沒載上所有人的Ark開始慢慢地上升了。?
第四十二話?帝厲魔襲擊家園，馴獸師的決心?
啟人他們從數碼世界平安回來，與各自的家人離開東京。樹莉因沒人接送，啟人便送她回松元。在回程時，啟人從電視新聞中得知了新宿的超高速大廈正被壹片赤黑起伏的帝厲魔(D-Reaper)所侵蝕。?
留姬及健良也從新聞中看見此事。不過健良的父親——鎮宇勸告他：這次的異常現象交給大人來處理吧。兩人雖然想到新宿，但又想留在親人身邊，內心不斷地掙紮。?
啟人乘坐電車返回東京。預定在八王子轉車，返回父母被疏散到的逗子那裏。不過他很擔心新宿的情況。啟人為了去那裏而感到苦惱。電車終於到達八王子了。?
第四十三話?心心相連，復活的墮天地獄獸?
另壹方面，小妖獸憑著昔日拍檔所留下的便條，希望找回它的拍檔。當然，小妖獸是不懂讀那些字的。於是它便托城市裏的人為它讀字，但大家當聽見是數碼寶貝便恐慌起來，根本沒人讀那些字。在小妖獸不知如何是好的時候，壹個不可思議的老人聲音傳出了。?
第四十四話?神秘的少女，帶來奇跡的杜賓犬獸?
啟人看見的真的是樹莉嗎？啟人因疑惑而打電話給松元的家。原來樹莉在松元的家失蹤了。而且是和啟人看見樹莉同壹時間的！?
壹名少女獨自在新宿走廊奔走。她那黑色Gothic?&?Lolita的服裝露出雪白的肌膚。還有壹只巨大的狗陪著她跑。壹回頭看時，竟有許多水母模樣的帝厲魔(D-Reaper)使徒！?
第四十五話?迎戰帝厲魔，突入占領區?
啟人他們得到杜賓犬獸的幫助，終於能進化成究極體！各人心中也有不同想法，現在他們在現實世界實現了究極進化。?
面對著巨人的帝厲魔(D-Reaper)地帶的泡，紅蓮騎士獸他們各自使出必殺技，不斷攻擊！?
當以為敵人收縮，帝厲魔(D-Reaper)最上部突然伸長出球體，迫近紅蓮騎士獸！?
紅蓮騎士獸被可怕的帝厲魔(D-Reaper)捉住了！?
第四十六話?豪爽的究極戰士，裁決獸登場?
在南新宿的大廈屋頂，鬥篷飄揚展現颯爽的究極體裁決獸出現了！當它得知啟人他們陷入困境時，便匆忙奔去了。留姬看見它那爽朗的揮手動作，便認定了裁決獸的真正身份了！?
另壹方面，被吸進帝厲魔(D-Reaper)地帶的啟人，他在那裏聽見樹莉的聲音。但其實那是帝厲魔(D-Reaper)使徒。它用樹莉的姿態用說話打擊啟人。就在啟人的意識離他越來越遠時，基爾獸的聲音從他耳邊響起了！?
第四十七話?搶救紅蓮騎士獸，葛拉尼緊急出動?
樹莉被“命運”的惡夢打擊。母親的死及獅子獸的死重叠壹起，令她受盡痛苦。這全都是命運，是不能逃避的……?
此時山木與Wild?Bunch的成員緊急進行提升Ark的開發。若然完成，便壹定能能打倒帝厲魔(D-Reaper)！?
帝厲魔(D-Reaper)的心臟部位位於都庁！可是瀕死的墮天地獄獸還有樹莉都在那裏。?
第四十八話?守護樹莉的力量，墮天地獄獸之拳?
在帝厲魔(D-Reaper)的中心Kernel-Sphere，無數電線綁著墮天地獄獸令它動彈不得。樹莉仍然目無表然地蹲坐著。?
另壹方面的墮天地獄獸也拚命地掙紮。它為了贖罪，奮不顧身要拯救樹莉，用盡全身氣力扯掉那些綁著它的電線！?
第四十九話?首都失守，古樂獸的願望?
在帝厲魔(D-Reaper)地帶中，清醒的樹莉被模仿自己的帝厲魔(D-Reaper)迫得很痛苦。古樂獸拚命拯救樹莉。?
樹莉的哭叫聲到達紅蓮騎士獸體內的啟人！此時都庁發出激烈的地嗚聲，帝厲魔(D-Reaper)開始呈現出單眼女神像的姿態。啟人當然沒有膽怯！但壹進入泡中便會解除究極體的形態，到底該怎辦才好？?
第五十話?真紅蓮形態，救出我的所愛?
數碼網格線在上空打漩，制造出壹個細小的地帶。各數碼寶貝解除究極體的形態。阿健取出SHIBUMI所制的紅卡，若SLASH那卡便能在帝厲魔(D-Reaper)中戰鬥！?
不過那張卡只有壹張。啟人、健良、留姬及阿遼舉起自己的數碼器，準備讓紅卡飛入。?
第五十壹話?有夢想才有未來（完結篇）?
樹莉把數碼器指向帝厲魔(D-Reaper)的墻壁，數碼器便射出耀眼的光芒！?
樹莉大喊自己新的領悟！“我的命運應該由我來決定！”?
此時，紅蓮騎士獸正在和帝厲魔(D-Reaper)展開壯絕的生死決戰。盡管把它們壹只只地打倒，但仍無法靠近樹莉所在的地方！?
接著樹莉的數碼器好不容易打破墻壁！但這個時候，壹團赤黑的黏液流進室內！液體填滿了樹莉所在的球體，奪去了她逃走的地方。?
紅蓮騎士獸在帝力魔本體附近被另壹只帝力魔阻擋，但最終打敗了他。就在大家要救出樹莉的時候，意外發生了。