故事講述的是保羅·亞崔迪統治“沙丘”星球後發生的壹系列事件。保羅·亞崔迪通過先知幻想得知由於聖戰以及自己的統治，人類最終會走向滅亡，而自己的愛妾（加妮）為了生下自己的繼承人死去，他極力想要避免卻無法阻擋命運的召喚。與此同時，各種陰謀在宇宙空間和沙丘中不斷醞釀。在電視劇第壹集結尾，失去愛妾和視覺的保羅以“人”的身份（在此之前，保羅因為統治和聖戰被神化）獨自走進了沙丘，從而為自己的兩個孩子(李特和伽妮瑪）贏得了人民的支持，而他的妹妹阿麗雅·亞崔迪成為了攝政王，繼續統治沙丘。第二和第三集主要講述的是保羅之子李特·亞崔迪二世（因為保羅的老爸也叫李特）和他的孿生妹妹伽妮瑪·亞崔迪從孩子成長為沙丘新的統治者的故事。區別於小說《沙丘之子》的結尾，電視劇中李特·亞崔迪二世最後放棄了王位，獨自步入沙丘，將重任交予了自己的妹妹。因為在與自己邪惡的姑姑阿麗雅·亞崔迪（阿麗雅想要繼續進行絕對的宗教統治，並且被哈肯寧男爵占據靈魂）的戰鬥中，李特犧牲了自己，與沙蟲融合，就是開始的那句——my skin wasn't my own.按照電視劇的發展，李特會慢慢地變成人型沙蟲。電視劇以“history is written on the sands of Arrakis.A chapter has ended.Swept away by the whirlwind.One door has closed.But another has opened.And on the other side our future.”的獨白結束。