明建文四年六月，神劍山莊的三少爺謝曉峰與外號“奪命十三劍”的燕十三在江邊為家族存亡、師門榮譽將有壹場比試！而這天也正是謝曉峰和慕容秋荻結婚的大喜日子。比劍中途，謝曉峰被他的結義大哥鐵鉉之妻呂香華帶走，臨陣退縮。誰也沒有想到他這次要面對的是壹個比生死還要嚴峻的考驗......
六月十七日，京城發生兵變，燕王朱棣率軍攻陷都城，繼承了帝位。鐵鉉帶著年僅七歲的遜太子朱文奎出逃，被朱棣派的大批高手追捕。萬般無奈之下，鐵鉉夫婦與謝曉峰合演了壹場苦肉計，鐵鉉把太子的服裝套在自己親生兒子的身上，讓謝曉峰殺死自己和兒子，以使敵人產生誤解就此罷手，不再追捕太子。這幕慘劇被躲在蘆葦中不明真相的錢鉉之女錢真真看到，她發誓將來要為父母報仇。
鐵鉉無畏生死，舍生成仁，但謝曉峰從此卻只能隱姓埋名，受盡屈辱，他為護主、為正義背上了不忠不孝不義的罵名，父親不堪家門受辱，自盡身亡，臨死前撒下江湖貼，請求天下眾英雄誅滅謝曉峰；慕容秋荻已有了身孕，慕容世家深感恥辱，把慕容秋荻趕出家門，慕容秋荻生下壹子，在老莊主的授意下，燕十三偷出嬰兒，流放河中。慕容秋荻得知後悲痛欲絕。
謝曉峰有家不能回、有親不能認，落魄鄉間淪為酒鬼阿吉，終日以酒為伴，壹日在江邊撿到壹個棄嬰，他把嬰兒送給了賣臭辣豆腐的丁財夫婦，他們為孩子起名叫“丁小弟”。後慕容秋荻嫁給錦衣衛指揮使紀綱，不久生下了女兒“紀芙蓉”。
十多年後的壹次偶然，讓紀芙蓉遇到了謝曉峰和丁小弟，紀芙蓉對丁小弟頗有好感，但所有人都不知道丁小弟和紀芙蓉竟是同母異父的親兄妹！壹直暗戀著慕容秋荻的燕十三得知所有事情的原委後，決心不顧面對的壓力，成全慕容秋荻和謝曉峰，紀綱不甘心，他千方百計地想陷害謝曉峰和燕十三。
十年磨壹劍，錢真真終於練成壹身絕技，重返中原後，唯壹的心願就是尋謝曉峰報仇。但在與酒鬼阿吉的深入交往中使她漸漸明白了這世上還有比仇恨、比殺戮更重要的東西。丁小弟終於有了出人頭地的機會，但他並不知道這些都是生身父母謝曉峰和慕容秋荻的刻意安排。紀綱由妒生恨，籌劃了壹場大陰謀，想把所有對手壹網打盡。謝曉峰本不想再介入江湖，但正義和良知促使他面對新的挑戰。
壹場明爭暗鬥也就因此展開，幾方勢力經過較量終見分曉，最終正義戰勝邪惡，良知喚回真情。燕十三開始了他浪跡天涯的日子，三少爺謝曉峰回歸神劍山莊，丁小弟去找失蹤了的母親。武當山上，謝曉峰與燕十三笑談往事，二人擊掌約定要進行壹場“真正”的比試，但他們知道劍術的精髓並非在於劍法的本身，而是在於人心善意的積累、人品道德的高尚