043江戶川柯南誘拐事件(父母知道變小)
048~049外交官殺人事件(平次登場，第壹次恢復)
054電玩公司殺人事件（組織）
057，058福爾摩斯迷殺人事件(平次知道身份)
128黑衣組織10億元搶劫事件
129來自黑暗組織的女子大學教授殺人事件（組織）
170，171暗閣中的死角（新出登場）
176，177，178與黑暗組織的再會（組織）
188－－193危命的復活（新壹，蘭）
226，227格鬥遊戲的陷阱（朱蒂登場）
230，231謎壹樣的乘客（赤井登場）
258，259來自芝加哥的男子（詹姆斯登場）
269，270犯罪的紀念品（有提到警察局關於毛利的案卷被偷壹事）
271，272緊急隱藏的省略（朱蒂）
277，278英語教師VS關西偵探（朱蒂）
284~285中華街雨中的似曾相識
286，287，288工藤新壹NY事件（不用多說了吧）
307，308無聲的證據（組織相關，下壹集的引子）
309，310，311與黑色組織的接觸（組織）
335，336東都顯影所的秘密（有神秘人）
338，339 4輛保時捷（朱蒂和貝爾摩德假扮的新出發現哀）
340，341隱藏在廁所裏的秘密（更多關於哀父母的消息，找到明美藏起來的錄音帶）
343，344便利店的陷阱（最後壹段是小蘭發現朱蒂藏的照片，懷疑朱蒂）
345與黑衣組織直面對決滿月之夜的雙重迷案（不多說了）
346，347尋找P股上的印記（上集案件的掃尾，關於哀拒絕證人保護計劃的事）
385-387 斯特拉迪瓦裏小提琴的不xx音
425 黑色的沖擊！黑色組織魔爪伸來的瞬間(水無憐奈登場，小五郎受到懷疑，若不是秀壹就掛掉了)
429--430無法回到從前的兩個人(本堂)
462 黑衣組織的影子 年幼的目擊者
463 黑衣組織的影子 奇妙的照明
464 黑衣組織的影子 謎樣的高額報酬
465 黑衣組織的影子 珍珠的流星
466 堅不可摧的雪人（前篇）
467 堅不可摧的雪人（後篇）
484 黑色照片的行蹤（前篇）
485 黑色照片的行蹤（後篇）
491 紅與黑的碰撞 開端
492 紅與黑的碰撞 血緣
493 紅與黑的碰撞 疾呼
494 紅與黑的碰撞 冥土
495 紅與黑的碰撞 昏睡
496 紅與黑的碰撞 侵入
497 紅與黑的碰撞 覺醒
498 紅與黑的碰撞 擾亂
499 紅與黑的碰撞 偽裝
500 紅與黑的碰撞 遺言
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
502 紅與黑的碰撞 潔白
503 紅與黑的碰撞 決死
504 紅與黑的碰撞 殉職
507 卡拉OK房間的死角（前篇）
508 卡拉OK房間的死角（後篇）
578 召喚危機的紅色兇兆
579 黑與13的暗示
580 逼近黑色時刻
581 紅色飄搖的目標
劇場版5：通往天國的倒計時
劇場版13：漆黑的追跡者
另：509紅白黃色與偵探團中是沖矢昂出現的集數，不知道算不算