本片又名《天蠶再變》,改編自黃鷹《天蠶變》及溫瑞安《布衣神相》兩部武俠名著,故事承接前作《天蠶變》。
故事描述,雲飛揚(徐少強飾)練就天蠶神功後,雖躍為江湖上兩大高手之壹,卻厭倦江湖,無心爭霸,與愛侶倫宛兒(劉雪華飾)隱居;而獨孤無敵(萬梓良飾)已練成滅絕魔功第十重,自部下處得知在自己閉關期間雲飛揚已練成天蠶神功,於是率門下前往武當,與雲決鬥。
另壹方面,東瀛甲賀忍者纖月蒼龍軒(陳觀泰飾)等欲稱霸中原,於是趁機血洗武當,並命人汙蔑於獨孤無敵。終於雲在得知此事後,同倫憤而挑戰獨孤無敵,雖自無敵口中得知滅武當者實乃織月,但亦敗於其滅絕魔功第十重下,幸得布衣神相李布衣(劉永飾)所助始得幸免。
兩人攜雲求醫於神醫賴藥兒(高飛飾)處,在神醫妙手回春下,雲終恢復。亦在此時,傳出無敵已死於纖月之手,於是雲與李攜手,終將纖月陰謀粉碎。