首先我們先來了解壹下殺手系列中主角的資料：
姓名(代號)：47
常用假名：托拜斯·瑞伯(TobiasRipper)
完整編號：640509-040147
性別：男
生日：1964年9月5日
性格：冷酷，沈默，精明
身高：188CM
身份：克隆人
職業：殺手
國籍：全球行動，無固定國籍
所屬機構：ICA國際合約組織
宗教信仰：無，過去為基督教
配音演員/臉模：大衛·巴特森(DavidBateson)
常用武器：銀色M1911改版雙槍、鋼琴線(又作光纖線)、W2000狙擊步槍
簡介：1964年，47作為壹項邪惡計劃中的實驗品來到了這個世界上，他那野心勃勃的創造者們為了能開發出變革整個世界戰爭格局的士兵，在47身上進行了各種可怕的實驗和訓練，而47則在度過自己30歲的生日之後被進行了洗腦，最終成為了壹個冷酷無情，沈默寡言，精明無比的終極殺手。
現在我們在來了解壹下殺手系列的劇情綜述：
首先殺手系列中的47的誕生是由於壹個叫做“五人團”進行的罪惡研究誕生的克隆人，由於47具有人性和社交能力從而被五人團中的奧特梅德所看重，希望47能夠在日後具有更佳的表現。
很快壹段時間過去了，直到1994年被奧特梅德寄予厚望的47度過了人生的30歲生日後，立刻就被投入培育倉進行了洗腦，在47洗完腦之後奧特梅德終於在1988年下手了，奧特梅德故意放走了洗腦完成記憶殘缺的47。
47在奧特梅德的故意下終於逃出了出去，經過47的能力表現終於加入了被稱為ICA的神秘殺手組織，至此47邁出了開始了他殺手人生的第壹步。
在1999到2000這整整兩年的時間裏，47以開膛手托拜斯(又作托拜斯·瑞伯，TobiasRipper)的假名執行任務，他通過ICA聯系人戴安娜(Diana)提供的任務簡報，先後在中國的香港、哥倫比亞的亞馬孫、匈牙利的布達佩斯和荷蘭的鹿特丹繁忙的執行著壹個又壹個的任務，盡管與他對陣的刺殺目標都是些狠角色，但對於經歷了三十年殘酷訓練的他來說，任何對手都不能阻擋自己的道路。不過47在最後根據自己的前後判斷，發現自己被利用了。
完成這些任務後，“固定雇主”為47安排了最後壹個任務，這個任務讓47回到了起點：羅馬尼亞的精神病院。對所有過去的任務有所懷疑的47明白，這個固定的雇主就是奧特梅德。在進入精神病院後沒多久，47就迎上了壹群裝備精良、來勢洶洶的特警，在壹陣眼花繚亂的槍林彈雨中，47殺出重圍來到了奧特梅德面前，他內心中那種從未有過的復雜情緒在滋長著，最終這種情緒促使他無情的殺死了奧特梅德。事後，47開始厭惡這種利用和背叛，也使得他在接下來的壹段時間裏，對今後要走的道路徹底失去了信心——在那個可怕屠殺發生的雨夜，47銷聲匿跡。
退隱之後的47在西西裏的壹所教堂中藏身，他將自己所有骯臟的錢全都拋給了教會，決定以壹個園丁的身份就這樣度過壹生。在這段時間裏，47結識了善良的維克多(Vittorio)神父，而神父在知道他過去的種種之後也給了他從未感受過的寬容，有了精神信仰的47更加堅定了自己的選擇，並始終相信自己壹定可以成為了壹個普通人。可是，無論怎樣，那從來沒有放過他的命運卻再壹次給他套上了枷鎖。
在壹個陽光明媚的早上，維克多神父被壹夥來自俄羅斯的黑手黨擄走，並且這夥黑手黨當場就獅子大開口，和47索要贖金，47被逼無奈，只好再次拿起那曾經最為信賴，如今卻無論如何都不想再碰壹下的銀色M1911雙槍——這場與黑手黨直面對決的戰鬥拉開了序幕。
這時47為了獲得更多了情報開始向ICA尋求幫助，ICA聽到了這個消息很高興，從而派遣了聯系人戴安娜為47提供情報，就這樣重操舊業的47竟然再次為壹個“固定雇主”做起了工作。
2004年，已經在殺手界馳騁數年的47早已成為壹個傳奇，這壹年的3月17日，47在巴黎歌劇院順利完成任務後，撤離途中卻被突然出現的巴黎當地警長阿爾伯特·法瑞爾(AlbertFarrell)開槍打傷，在壹陣混亂中，47以最快的速度逃離了現場，回到了自己藏身的公寓，之後在巴黎機場，47見到了前來迎接他的聯系人戴安娜，戴安娜希望47能接下壹個非常重要的工作，由於薪酬非常不錯，所以47立刻乘機前往了美國，他希望在美國可以有更廣闊的發展。
2005年，全美總統大選開始，現任總統為了獲得更多民眾的支持，正式公布了針對全美克隆人加快合法化、被外界稱為25號修正案的文書，眾多競爭對手為了阻止總統的政策實行，從而選擇消滅掉他，副總統提拔了壹個在壹定程度上控制了全美政體的組織“Franchise”的亞歷山大(Alexander)為議會代表，決心以此減緩總統的政策實行速度，為自己爭取到更多的時間
總統在這段時間裏卻聯合了ICA來對抗Franchise，由於ICA當前在美國地區擁有47這樣壹個殺手，最重要的是47還是壹個克隆人，陰錯陽差的有選擇到了47的身上，所以記過壹段時間的對峙，ICA在國際的影響力再大，它也不過只是壹個單純的刺客機構，又怎麽能敵過在美國本土早已根深蒂固的Franchise呢?ICA逐漸在美國本土勢力衰退，而Franchise也趁火打劫，把所有精力都聚集在了47身上——曾經被47視為無法擺脫的利用與背叛，在美國被進化到了政治的高度。
久而久之47被標註了“危險”的符號，壹次次的任務完成之後，47發現戴安娜與自己斷去了聯系，這種異象讓47知道ICA內部壹定是出現狀況了，漸漸的。47破除了副總統的陰謀。
事後，47等待著Franchise不可避免的到來，可是戴安娜卻先來壹步，她告訴47整個藏身處都已經被Franchise包圍，47無論如何都是逃不出去，但47卻堅定的表示有自信殺出重圍。勸解無用的戴安娜為幫助47，趁其不備將假死藥註射到了他的體內，隨後Franchise破門而入，回收了47的“屍體”。
幾天後，Franchise的頭目亞歷山大出現在了媒體的鏡頭下，他通過編造47的故事來扭曲克隆人在公眾心目中的形象，並借助為47舉行葬禮來獲得更多的輿論支持。可是，很少有人知道，這個亞歷山大雖然壹直在反對克隆人合法化，但他本人卻壹直是個狂熱的克隆人愛好者，他對奧特梅德教授創造的第四代克隆人極有興趣，而身為這個批次唯壹存活著的47，就成為了他本人壹直想要得到的實驗樣本——他希望借助研究47，制造出超越現有的馬克(Mark)系列的克隆人。
47的葬禮上，戴安娜趁所有人都醉心於討論克隆議題的空檔，將假死藥效解除，然後匆匆離開了現場。結果，這個本來讓亞歷山大覺得更接近自己夢想的日子，成為了在場所有Franchise成員的末日。再度埋葬了圍繞著利用與背叛的所有人後，47更加堅定了他所選擇的道路。從此，他將以殺手界教父的地位繼續征途
殺手5赦免劇情發展：
戴安娜私自從組織裏帶出來了壹個女孩，並且刪除了組織裏面很多重要的文件，讓他們受到了很大的損失，
所以上面給47下令幹掉戴安娜並把女孩交給他們。
戴安娜在臨死的時候把那個女孩托給了47讓他保護她.
47因為略微有些後悔殺了戴安娜所以接受了這個任務，也脫離了ICA，
這時由於47未把女孩交出，上面也把47作為暗殺目標。
就這樣遊戲按著這個劇情往下發展了。