明朝宦官當道，大都惡貫滿盈，國家飽經宦官摧殘。掌舵東廠的都督王安與錦衣衛指揮使牛國棟表面上彼此尊重，實際則針鋒相對。世襲錦衣衛的趙正目睹民間之慘況，決心為民請命。
內閣首輔葉向高之女兒葉敏因誤會結識趙正，二人卻情牽壹線。嗜賭如命之魏進忠欠債逃亡，無意中助救太子，並得東廠都督王安賞識，自閹入宮為太監。
邊境戰況危急，瓦剌兵犯境，皇上卻只派趙正率朱大典及張震三人作援軍，三人帶備工部尚書李友設計之『鷹之翼』、『火弩』、『連環弩』、『刺?甲』、『潛望鏡』等新武器上陣。
第二集
趙正、朱大典及張震智勇兼備，凱旋歸來，壹戰成名，皇上賜名『錦衣三劍俠』。皇上突然患上怪病，葉向高心感奇怪，加上黃太醫離奇死亡，與對醫藥頗有學問之女兒商議後更覺事有蹊蹺。葉藉調查此事，借意親近趙正。
年幼的太子喜歡新奇事物，對李友設計之玩意甚感興趣。壹日偷走出宮時竟遇見葉敏，驚為天人。
第三集
趙正壹幹人等發現黃太醫原是被人毒殺，調查中發現廠衛遺下的腰牌，上司牛國棟令三劍俠暗中查究，趙等人便由王安方便著手調查。
太子心系葉敏，終日悶悶不樂，魏進忠為討太子歡心，介紹不同民間玩意。魏在宮中遇上容氏，百感交集。原來二人本為夫婦，惜當日魏為避債而拋妻舍子，現在容氏已為上司之妻，心感悔意。
調查皇上怪病壹事苦無頭緒，趙正懷疑事件與鄭妃有關。神秘高手三番四次出現阻撓，原來是毒王霍星，趙正更被毒暗器所傷，幸得牛國棟及時相救。
第四集
趙正受傷，葉敏悉心照料，二人感情邁進壹步。皇上怪病壹事喜得線索，趙正從王安口中得悉事件與鄭妃有關。
原來魏超勾結鄭妃壹夥，密謀毒殺皇帝，欲挾太子，垂簾聽政。現在唯壹沒結黨而可信賴之人便只有魏進忠。王安令魏進忠接近魏超調查真相，魏進忠得立功機會，亦欲與容氏發展地下情，欣然答允。
調查中，魏發現驚人秘密，原來幕後主腦正是錦衣衛指揮使牛國棟。朱大典、張震追捕之。
皇帝駕崩，太子與容氏被鄭妃挾持於慈寧宮密室內，趙正前往營救。
第五集
大殿之上，皇太後以『國不可壹日無君』為由，欲立鄭妃之子繼承皇位，葉向高等忠臣極力反對。太後定下兩日時限，如未能找得太子回來登基，便依太後之決定。
牛國棟得悉事敗，奪走武器倉庫之『連環弩』及『百花匣』等犀利武器，決與趙正拼命。魏進忠雖相助，但趙不敵且形勢危急。朱大典、張震趕至，成功營救太子及身受重傷之趙正。魏進忠乘混亂救出容氏。
兩日時限已至，太後欲宣布鄭妃之子登基時三劍俠及時趕至，葉向高立時義正嚴詞地宣布太後及鄭妃判國之罪。鄭妃被捕，霍星突然出現，糾纏間霍星反中自己的毒器，後逃去無蹤。
第六集
太子終於在趙正等人合力扶持下得以順利登基，趙正與魏進忠護駕功勞最大，趙正並取代牛國棟之位，擢升為錦衣衛指揮使。張震及朱大典亦升為左右副指揮使。
魏進忠順理成章取代魏超之位，升任為承運監。魏冒險救容氏，容氏深受感動，更由
皇帝親自下旨，與容氏結合為合法之對食夫妻。
皇帝年幼，朝中每日煩鎖之國事，令他苦不堪言。相反卻喜愛研究土木工程，決定親自建造壹遊樂場，名為怡樂園。國事則交由各大臣處理。
皇帝在怡樂園中巧遇心上人葉敏，葉敏以為他是壹般木匠，對其手藝大加贊賞，皇帝自覺才華終獲別人欣賞，自此對葉敏夢縈魂繞。
魏進忠意氣風發，衣錦還鄉，壹日途經“忘憂館”邂逅老板娘如心，留下深刻印象。途中再遇毒王霍星，原來霍星當日反中己毒，須自斷雙腿存命。霍懇求魏救其愛人鄭妃，魏壹心留霍為己用而答應。魏亦於途中收養壹身材魁梧之弱智青年為義子，起名為魏存孝。
第七集
容氏與皇帝壹向情如母子，見皇帝自怡樂園歸來後悶悶不樂，雖未能打聽其心上人下落，卻為其挑選了姚妃當皇後，然而皇帝之心仍掛葉敏。
另壹邊廂趙正與葉敏之感情漸進，趙母更催促二人早日成親，惜趙正以國家為重，葉敏亦不作勉強。
魏進忠勾結各地貪官，廣征賦稅，引至各地行業相繼倒閉，民不聊生。紡織女工唐嵐性格掘強，不甘受壓，組織工人發起抗稅大遊行，壹發不可收拾，演變成壹股抗朝勢力義軍，令魏大為不悅。
第八集
魏回京，所搜刮之財富不少。但仗著魏容二人與皇帝之親密關系，朝中各臣敢怒不敢言。老太監王安上奏皇帝卻未受理會，容唆擺魏鏟除王安。
民變勢盛，朝廷派趙正調查，暗地裏搜羅魏貪汙之證據。沿途所見盡是民生困苦，更對唐嵐正義之行為心生敬意。
趙正終找到魏貪汙之證據，途中卻遇上神秘殺手襲擊，趙雖及時退敵，但證據已失。
第九集
魏設計殺害王安，令小太監假傳王安急病而死。葉向高等忠臣雖懷疑其死之真相，但苦無證據。魏最終也代替王安，控制朝中最大勢力之東廠。
趙正帶同指證魏罪行之縣官回京，朱大典及張震得悉事態嚴重前來保護，惜二人到達時，趙手下卻稱縣官已畏罪自殺。三人雖覺可疑，但亦無可奈何。
魏進忠自與容氏結為夫妻後，雖有夫妻之名，卻無夫妻之實。容氏無處宣泄，唯有不斷向魏苛索金錢，更不時對魏呼喝謾罵，魏寧願早出晚歸，但始終對容氏心存歉意，只好盡量忍受其無理取鬧。
第十集
魏進忠把霍星與存孝安排在沼澤山洞內居住，命霍星教孝武功，欲訓練他成壹個殺人機器，二人對魏更是唯命是從。此時魏進忠之勢力已不斷擴張，成為有史以來最龐大的貪汙集團。
皇帝整日待在怡樂園，身為好友的趙正查問之下，發現其正暗戀壹女子，葉敏竟於此時出現。此時葉敏才得知木匠乃皇帝，三人頓時不知所措。
皇帝須知葉為趙之戀人，但未能忘記葉之醉人笑臉，暗地裏與趙正比較，天真地以為自已若似趙正武功高強，或可得葉敏之芳心，遂請教李友天下第壹武功。李友暗喜皇帝終於醒覺，道出傳說中以『天怒劍』與『天怒劍法』的故事。原來相傳戰國時有壹威武大將軍擁壹絕世寶劍，名為『天怒』，配合『天怒劍法』成為天下無敵。傳說『天怒劍』為不祥之物，飲血太多成為人間兇器，最後劍和劍譜皆輾轉落入天龍寺中，多年來寺內之高僧每日念經，超渡劍上亡魂。
第十壹集
皇帝決定要遠赴天龍寺訪尋驚世絕學。魏得知欲隨皇帝同行，伺機奪得『天怒劍』與劍譜，心中亦希望順道到忘憂館再會善解人意的如心。二人再會，秉燭夜談，如心只知眼前之人有別於其它達官貴人，卻不知魏乃太監。
唐嵐得悉皇帝微服出遊，率領義軍欲推翻貪汙的皇朝。皇帝被義軍俘虜，幸得趙正向唐嵐解釋魏乃罪魁禍首。義軍伏擊魏，霍星及魏存孝突然殺入，天生神力的存孝已成高手，打退義軍。
第十二集
壹行人終於到達天龍寺，全寺大為震動。皇帝道明來意，主持頓時面上變色。皇帝大怒，令主持交出『天怒劍』與劍譜，否則將天龍寺移為平地。
趙正從主持口中得悉當年武功蓋世的大將軍最終遭『天怒劍』反噬，擔心皇帝之安全，然皇帝壹意孤行，反以為趙正害怕壹天自己學成絕世武功，實力反勝趙。此時天龍寺突然失火，原來魏欲強搶劍和劍譜，主持為全寺僧侶性命著想，最後交出『天怒劍』與劍譜。
第十三集
魏奪得『天怒劍』與劍譜後，馬上秘密復制劍譜，並暗留最後兩頁心法。魏將『天怒劍』和假劍譜交皇帝，皇帝歡喜若狂。
『天怒劍法』果然名不虛傳，皇帝只練了月余，尋常廠衛已非其敵手，心裏暗喜自己很快便可超越趙正。
天龍寺壹役，趙正發覺皇帝已非當日善良膽寒的太子，以為乃受魏之影響。葉敏誤以為趙正擔心皇帝橫刀奪愛，連忙表明立場，趙亦向葉承諾自己心不變。靖南王郡主芷菁自初見趙正已心暗戀，唯此時見趙葉二人如此恩愛，心感淒涼，張震前來安慰。
邊境金兵作亂，朝廷連番錯敗，禁軍將領孫承宗被旨派領兵出戰，臨別時不忘叮囑趙正好好保護皇帝。
第十四集
魏之龐大貪汙集團乘勢運作，以邊關開戰為由廣加賦稅，其中大部份被魏中飽私囊，更屯積糧食，百姓生活更困苦。唐嵐與義軍決定打劫糧倉，振濟災民。魏得悉大怒，誓要鏟除義軍。
當日魏答允霍星救鄭妃，霍星多番追問，魏心生壹計，假意營救鄭，並報局令霍以為因趙正之阻欄才引致鄭妃之死，霍星發誓殺趙正報仇。
鑄劍山莊命案轟動京城，張震奉命前往調查，發現絕非壹般江湖仇殺案，張震懷疑與魏之手下周豹有關，遂與朱大典前往問罪，惜被周逃脫。魏得知，借口設宴欲收買二人效力，二人當場拒絕同流合汙。
第十五集
皇帝每日勤奮練功，恨不得馬上與趙正比武。魏心知皇帝掛念葉敏，建議皇帝借劃觀音像為名，傳召葉敏入宮作劃畫之對象。葉敏接到聖旨欲婉拒，父葉向高卻希望女兒能把握機會進言。皇帝終能再見葉，當然欣喜若狂，二人之隔膜亦漸漸打開。
張震與芷菁的感情有所發展，二人更自創『眉來眼去劍』及『打情罵俏掌』，令壹直暗戀張震、葉敏之妹妹小暄甚為妒忌。
趙正從張震口中得知周豹壹事，硬闖廠衛營成功擄走周。嚴刑迫攻下周終承認主腦是魏，並答應指正其罪行。魏大怒，令大批廠衛迫趙正交人不果。葉向高怕夜長夢多，令趙正馬上押周入宮，向皇帝道出真相及魏之罪行。魏得悉，連忙派霍星與存孝追截，並殺周滅口。趙正等人早已逃之夭夭，魏唯有另生計謀。
第十六集
魏深知皇帝自小對容氏如己母，心生壹計派人通知皇帝容氏病重，皇帝立時趕回探望。趙正等人到達時，皇帝已離去，唯有秘密地將周囚在張震家中。
霍星對鄭妃之死哀痛不已，帶同存孝到有份害死鄭妃之清流家中大開殺戒。趙正接報
，發現墻上遺下之劍痕武功之高靡而所思，對高手之身份更百思不得其解。
霍星與存孝到張震家救周豹，存孝武功怪異，加上天怒劍法，張震、朱大典招架缺力，芷菁更舍身救張，張悲痛欲絕。存孝成功挾走周，周最終卻被霍星毒死。
第十七集
大殿上靖南王因愛女身亡，怪罪張震，張終被革職處分。趙正欲安慰張，反被張狂罵，兩兄弟更動武起來。種種情景被魏手下廠衛秘密窺視。張自始自暴自棄，終日借酒消愁。
魏因周豹事件，與黨羽商討對付趙正之良策，決定先要對付朝中清流，其間對容氏之橫蠻無理更感煩躁，心中不禁想念溫柔典雅的如心。趙正亦與朱大典專心研究如何保護清流，不覺間冷落了葉敏。魏更向清流之楊年首賊贓嫁禍，葉向高雖力保清流，亦愛莫能助，自此更失去皇帝之龐信。幸得葉敏對皇帝諫言清流之事，皇帝之聖旨及時於行刑前趕到。
容氏誤殺姚妃，魏趕至並消滅所有證據，趙正追查兩婢女，期間初遇存孝，趙正險被天怒劍所傷。
第十八集
張震壹直假裝意誌消沈，易容企圖暗殺魏，驚見魏武功突飛猛進，急忙退走。趙正到訪，礙於廠衛之監視，張再借意爭吵，暗將字條交予趙。魏開始相信張震不足為患，並企圖收買他，張假意答應，更故意與朱大典為敵，終獲魏之信任。
趙正奉命押送及護忠良後人往邊疆，葉敏臨別依依，趙卻只記掛與張震交換情報。
霍星目睹當日存孝與趙正之戰，有感天怒劍法始終未能發揮最大威力，決定以毒物摧谷。此時存孝之獸性亦漸嚴重，成為壹個真正殺人機器。二人以血祭劍，現在只欠數名高手之血，才達最高威力。
第十九集
趙正與數名錦衣衛出發，魏暗中帶廠衛高手隨後跟蹤。同時間唐嵐接報，壹並追隨。
關外唐嵐遇上張震及少林高手，誤以為是廠衛，趙正趕至，及時化解紛爭。趙正與唐嵐三次邂逅，彼此互相仰慕之情，不自覺更進壹步。趙正坦然已有未婚妻，唐嵐只有大方地祝福二人。
魏之手下在水井中落毒，霍星與存孝此時亦至，趙正等人笈笈可危，唐嵐建議暫時殺馬充饑。
邊關戰況激烈，孫承宗之軍隊雖勇，但地方貪官扣押糧餉，未幾便成兵變，內外受敵。
第二十集
少林高手終於找到水源，忽遇霍星和存孝不敵，成『天怒劍』下亡魂，『天怒劍』再吸高手之血，已達駭人境界。趙正等人至發現屍體，眾人欣喜再嘗甘露之余，卻擔心安危，趙遂派人馳邊關找孫承宗求援。
霍星及存孝追至，唐嵐與趙正力戰二人，難敵『天怒劍』之威力，危急之際孫承宗帶精銳部隊解困，霍二人逃去無蹤。決戰中，唐嵐舍身救己，趙正心生感激，卻刻意壓抑愛意。孫見唐嵐義薄雲天，勸其領義軍歸降朝廷，唐嵐卻拿不定主意。
孫托趙回京催促軍餉，趙正與唐嵐依依惜別。
第二十壹集
朝中大臣爭相認魏進忠為幹爺，魏沾沾自喜，更是忽略容氏，時常在如心之忘憂館中夜宿。
趙正回到家中，葉敏難掩思想之情，趙母乘機促二人成親。國難當前，加上趙正對唐
嵐之情，欲借意推搪，最後亦答應婚事。
邊關金兵之危依然未除，軍心動亂，義軍起義，攻占城池。葉向高多次面聖，皇帝卻只專心練劍，未加理會，並因練『天怒劍法』令性情變得喜怒無常。趙正回到錦衣衛軍營，驚覺大部份錦衣衛已歸魏進忠，加上張震搜集魏之罪證失敗，趙正更是驚惶失措。
趙母欲與葉向高商量二人子女之婚事，卻遭其反對。原來葉向高壹心希望愛女可接受皇帝，並扶助其對抗魏日漸龐大之勢力，葉苦勸趙正放棄葉敏。葉此番話語重深長，趙正亦心明大義。
第二十二集
為國家著想，趙決定避開葉敏，但內心郁悶，唯有寄情劍術，無意中創出悲情傷痛的『悲情劍法』。葉敏亦同受感情煎熬，無奈接受現實。
葉向高向皇帝議婚，皇帝竟壹口拒絕。魏進忠得悉，急派張震探聽。張回到家中，見小暄為己處理家務，心裏感動卻未能表露。
原來皇帝為證明己實力，決意在武術上超越趙正，從而得葉敏芳心。更親下戰書，趙正今番許敗不許勝，魏更借機在皇帝之假天怒劍上放毒，誓要借皇帝之手殺死趙正，趙性命危在旦夕。
第二十三集
比武開始，最關心戰況的當然是葉敏。趙正刻意露出小破綻，皇帝以天怒劍將其刺傷，趙戰敗卻不知自己已中奇毒。張震探得魏之奸計急趕至，馬不停蹄帶趙趕往少林寺求救，終能保命。
魏本派手下監視趙正毒發及突然出現趙家的張震，張震為救趙正失蹤數天，魏開始對其產生懷疑。
第二十四集
趙正雖沒性命危險，少林高僧破例傳授易筋經，元氣漸復。趙無意間使出『悲情劍法』，少林高僧加以指點，頓時茅塞頓開。
皇帝終於戰勝趙正，葉敏正式嫁入宮中，策封為皇後，容氏卻感兒子已遠離，倍更寂寞。葉在皇帝身邊輔助，皇帝對國事變得積極，更令開倉賬災，減輕賦稅，朝中上下頓時手足無措。在少林寺養傷的趙正得知，亦心感安慰，此時傷勢漸愈，決定告別少林，無意間竟來到唐嵐之軍營。二人告別重逢，對酒暢飲。
第二十五集
魏進忠發現張震暗中搜集自己的貪汙證據，令霍星及存孝捉拿之。嚴刑之下，張震守口如瓶，拒絕透露趙正下落。
皇帝在葉敏之鼓勵之下已成壹位好君主，亦開始明白國庫空虛、吏治千瘡百孔之弊，連番審查。魏恐怕貪汙舞弊之事露，與容氏商量對付辦法，二人皆認為當前急務必先鏟除葉敏。
葉敏與皇帝朝夕相對，喜見皇帝為己改變，二人感情已躍進壹大步，與趙正之情亦漸淡。
張震失蹤，小暄非常著急。朱大典得悉真相，跟蹤魏進忠查探。另壹邊廂，趙正與葉敏結伴往邊關助孫承宗，攜手抗金兵。
第二十六集
邊關孫承宗軍隊面臨崩潰，皇帝率領群臣相議勝任人選，皇帝卻只想起趙正。魏擔心趙正再被重用，急忙引薦魏存孝當錦衣衛指揮使。
容氏不滿皇帝對葉敏之龐愛，忽略自己，多番建議魏進忠篡位，唯魏仍有疑慮。
正當孫承宗之軍隊士氣日漸低落之時，趙正與唐嵐領義軍投靠，軍心重振，再戰金兵小勝。
錦衣衛比武奪帥之事傳至邊關，唐嵐陪同趙正回京，並與魏進忠周旋。
第二十七集
魏自從容氏多番建議篡位，野心日盛，更秘密自制龍椅龍袍，暗喜成功暗日可待。
比武之日，趙正趕回京，存孝以『天怒劍法』打敗朱大典，震服群雄。趙突然出現，發揮練成的『悲情劍法』，擊退存孝，重奪指揮使之位。
趙正與朱大典成功地深入虎穴，救出張震。小暄與張震久別重逢，張更向小暄求婚，皆大歡喜。
第二十八集
小暄與張震大婚之日，趙正與葉敏重遇，二人均已心有所屬。魏使計安排趙葉二人私下走在壹起，特意通知皇帝，令其以為二人舊情復熾，魏終奸計得逞。
趙正雖練成七式『悲情劍法』，但未能突破最後壹式『悲歡離合』，唐嵐從旁協助。
容氏得悉魏進忠終日流連忘憂館是為了如心，怒火中燒，遂假傳魏之意思，令存孝前往忘憂館，糾纏間存孝殺死如心，魏得知大怒。魏進忠與存孝各自使出『天怒劍法』比並，霍星及時阻止二人自相殘殺，魏決定讓存孝帶罪立功。如心死後，魏化悲憤為力量，決意與天賭壹註。
第二十九集
魏之篡位大計展開，先派霍星、存孝赴邊關暗殺孫承宗，派容氏挑撥皇帝與葉敏，自己則假意整頓錦衣衛，暗地裏對付趙正。魏主動調查貪汙之士，更找來壹些替死鬼，皇帝認為魏居功不小。魏更誣告孫承宗與義軍串謀癲覆朝廷，皇帝半信半疑，趙正主動提出派己調查。
霍星與存孝自邊關帶來孫之人頭，魏得知心腹大患已除，突出手殺死二人。容氏大驚之余，喜見魏變成真正大丈夫。
第三十集
趙正以為經歷過多番悲歡離合後可以練成『悲情劍法』之最後壹式『悲歡離合』，但實質上則尚有距離。二人回家，喜見趙母接受唐嵐，深感歡喜。
魏進忠挑撥皇帝與葉敏，易容成趙正潛入葉敏寢宮，容氏帶皇帝前來捉奸，皇帝大怒，下令捉拿趙正。魏更散布謠言，將屠殺義軍之行動嫁禍趙正。
大派錦衣衛到趙家，趙母冒死引開他們，不慎被擒。趙正本欲向皇帝解釋，但當務之急便是保護葉敏和葉向高。
容氏假傳聖旨，稱葉敏不忠，賜飲毒湯。
第三十壹集
皇帝獨自呆坐幹清宮，大批錦衣衛湧至，以抓刺客為名，捉皇帝為實。朱大典與張震奮力保護皇帝，並救出昏迷不醒的葉敏，張震雖身中多箭，仍殺出重圍，皇帝始如夢初醒，追悔莫及。
趙正、唐嵐趕至，張震已失血致死，葉敏亦返魂無術。眾人傷心之余，急趕回宮中營救皇帝。
朱大典雖保護皇帝殺出重圍，但魏進忠手中『天怒劍』盛，朱大敵為君殉難。魏正欲殺皇帝之際，趙正以『瓦刺寶劍』使出『悲情劍法』對付，壹場生死劇鬥展開，二人不分高下。此時容氏挾趙母要脅，趙母寧自盡當場。趙正壹生之悲情頓時爆發出來，使出『悲歡離合』壹式，卻只能刺傷魏。正當魏沾沾自喜之際，鮮血隨劍身流至『天怒劍』上，劍突然向魏反噬。風雲變色，雷電交加擊中魏，魏當場電死。雨過天晴，朝廷終能逃過大難。