1集~44集（東海篇）
路飛童年時受到海賊“紅發”香克斯的啟蒙，自小就立誌要成為“海賊王”。路飛17歲時，戴著“紅發”香克斯托付的草帽，只身從故鄉風車村出發。途中他遇到在“亞爾麗塔海賊團”打雜的少年克比，在打倒海賊團的船長“鐵棒”亞爾麗塔後，路飛得知東海有個外號“海賊獵人”的劍士羅羅諾亞·索隆，並想要拉攏他成為夥伴，遂與可比兩人來到被海軍支部上校“斧手”蒙卡統治的謝爾茲鎮。
45集~130集（阿拉巴斯坦篇）
草帽壹行人來到小花園，與“青鬼”東利和“赤鬼”布洛基“相遇。並在此遇上了巴洛克工作社的高級特務“Mr.3”和“Miss Golden Week”。“Mr.5”和“Miss Valentine”也為了追殺草帽等人從威士忌山峰來到小花園與“Mr.3”搭檔會合，最後被草帽壹行人擊敗。
131集~193集（空島篇）
乘著上升海流，草帽壹行人來到了海拔壹萬米高空的“白海”。大夥原本冀望能夠在“空島”享受不用擔心海軍的愉快時光，卻莫名其妙被冠上了“非法入國”的罪名，被迫接受“神之島”阿帕亞多上四神官們的“試煉”考驗。
在阿帕亞多的生存淘汰賽中，空島統治者艾尼路以壓倒性的實力擊倒眾人，後來在香朵拉又將不配合他的其余生存者們通通擊垮，只留下了表示願意投降的娜美。艾尼路真正的計劃是打造壹艘大型飛船方舟“箴言”，並帶著來山迪亞人打造的巨大黃金鐘樓前往“無限大地”（實際上那是月球），同時意欲將“空島”打回藍海。
194集~323（水之都前篇）
草帽壹行人在羅賓和路飛痊愈後，為了尋找船匠夥伴和修理前進梅利號而來到以造船出名的水之七島。羅賓與喬巴在鎮上逛街，因羅賓被CP9脅迫，故而離開草帽壹夥。“前進梅利號”因“龍骨”已經嚴重受損，無法航行到下壹座島。路飛以船長的立場決定更換壹艘新船，烏索普對這突如其來的決定感到相當震怒，與路飛決鬥，最後戰敗然後離開了“草帽壹行人”
324集~381集（恐怖三桅帆船篇）
壹行人撿到壹個祭祀海神的酒桶，打開後裏面竟沖出詭異的紅色閃光，接著萬裏陽光號因暴風雨而航行到魔幻三角地帶，在那裏遇見吃了“黃泉果實”的神秘骷髏人布魯克，就在他們和布魯克對話時，船漸漸駛向世界最大海賊船“恐怖三桅帆船”，從以前就想要個音樂家的路飛邀請布魯克成為同伴，但由於失去“影子”的布魯克不能照射到陽光，因此拒絕了路飛的入團邀請，並壹個人跑到島上。
382集~408集（香波地群島篇）
離開“魔鬼三角地帶”後，草帽壹夥來到香波地群島為船鍍膜從而前往魚人島。在尋找上膜工人的途中，認識的人魚凱米被綁架集團“獵狗寵物團”綁走並送進拍賣場進行拍賣，草帽海賊團召集“飛魚騎士團”將他們載到“人類拍賣會場”。會場上魚人小八被天龍人開槍射擊，路飛憤而打傷天龍人，導致“天龍人事件”發生。
壹行人在會場得到羅傑海賊團的副船長“冥王雷利”幫助後，順利離開人類拍賣會場。而受“天龍人事件”影響，海軍本部大將“黃猿”來到香波地諸島，眾人不敵，雷利前來相助，但也引發混戰，後來全團船員更被突然出現的“王下七武海”之“暴君”巴索羅米·熊的能力傳送到別的地方去。
409集~498集（頂上戰爭篇）
路飛為了救出哥哥艾斯，先是闖入世界第壹的大監獄——推進城“因佩爾頓”，隨後集結了在推進城認識的安布裏奧·伊萬科夫，“海俠”甚平等人來到原海軍本部所在的島嶼“馬林梵多”，加入頂上戰爭。
在路飛的不懈戰鬥，以及眾人的幫助中，路飛成功救出艾斯。隨後卻因為大將“赤犬”薩卡斯基的阻擾，艾斯為保護路飛而死，面對死在自己面前的哥哥，路飛受不了打擊而失去意識。清醒後，從失去哥哥的打擊中恢復過來的路飛接受雷利的建議，向分散在各地的同伴發出信息，約定兩年後在香波底群島再會。
499集~520集（重聚篇）
草帽壹行人得知路飛在頂上戰爭中失去哥哥的消息後，紛紛用各種方式想要回到香波地群島。但稍後路飛卻利用返回海軍本部敲響“奧克斯大鐘”吊唁的事件，向大家傳達“只有夥伴才知道”的特殊訊息－草帽壹行人在報紙上看到路飛身上的紋身“3D(X)2Y”後，明白了這是要將之前約定重聚的三天之約，改為了兩年之約；大家也為了路飛，在此兩年期間各自修練以增強自己的實力，兩年後重聚“香波地群島”。
521集~574集（魚人島篇）
草帽壹行人正式潛入深海來到魚人島。並打敗了企圖攻占“魚人島”主權的“新魚人海賊團”與狂追求“白星”的範德戴肯九世。之後路飛向甚平提出希望他加入草帽壹夥。甚平則以自己仍有未完之事婉拒，答應路飛壹旦事情解決，非常樂意加入草帽壹夥。
因為擔心“魚人島”的安危，魚人島國王尼普頓和甚平商量如果脫離了“BIG MAM”的庇佑，願意讓“魚人島”借用草帽壹行人的名聲來維護居民安全。此時王國守衛來報，“BIG MAM”的部下前來收取點心的消息
575集~578集（Z的野心篇）
這幾集是給《海賊王》第12部劇場版——最強之敵Z做鋪墊，要講述了草帽海賊團遇見海軍前大將澤法前所發生的各種故事。