1號島：在北部看見壹個山洞，洞內有溫泉，泡溫泉可以恢復精靈的體力，而且上面的那個老爺爺還會給妳6號秘傳機器（碎石）。出來後繼續往北走，發現壹座山。走到山頂，出乎意料，山頂居然有壹只火焰鳥（Lv50）！收復它然後回到1號島的 PC恢復，接著坐船到2號島。
2號島：到了2號島，發現壹座特殊的房子（如圖），進去之後有事件發生，主人家的小孩去3號島采集至今未歸家所以請求妳幫助尋找。在這所特殊的房子左邊的那個房子裏，可以讓精靈學習以前的招式，條件是兩個小香菇，壹個大香菇（可以從派拉斯身上獲得），就和以前心靈鱗片壹樣。另外這個小島的山頂上有個人可以教給精靈三種厲害的招式，別錯過（只有主角精靈能學）。然後再坐船去3號島。
3號島：到了3號島，看到單車黨，單車黨與居民發生沖突，後來與單車黨交手。解決他們之後，居民為了答謝，送給我禮物！再往西北邊走，看見壹片樹林，在樹林裏找到了小女孩，突然這時有壹只Lv30的素利普跳了出來，打敗它之後救出小女孩。把小女孩送回她家。他爸爸為表感謝，送了件禮物給我！再回到1號島的大型PC裏最後被人送回了紅蓮島。
通關壹遍，抓住超過60種精靈，然後去博士那裏升級成386版圖鑒，之後到港口坐船去第壹個小島的火焰山，右邊有兩個火箭隊隊員，打敗他們進入山洞，在山洞中要使用秘傳機04怪力推石頭後才能到達深處，得到紅寶石。回去在1號島的PC把寶石給博士（如圖），便得到船票，之後可以坐船去7個島。
4號島：在4號島壹下船就會遇見對手小茂，但說了幾句就跑了……值得註意的是，在這個小島可以養精靈（如圖）^_^然後到商店旁邊的屋子和裏面的人對話，再用沖浪過右面的壹個小湖，來到壹個冰洞。註意，洞內有些地方需要踩冰，踩兩次就會掉到下壹層。另外還有滑冰，要利用冰塊上的石頭轉換方向。洞裏可以拿到秘傳機器07（登瀑布），有個地方要使用登瀑布進去，之後可以遇見四天王之壹—冰天王，旁邊還有火箭隊的人，與其談話後會發生戰鬥，贏後會告訴妳口令。得到冰天王的感謝後回到坐船那裏，出發去5號島。
5號島：到達5號島之後到左上方那裏使用沖浪，下水後往左走，登陸之後和如圖這個阿伯對話，他會給妳壹顆蛋（孵化出No.175波克比）。繼續前進會到達壹個小島，上面有山洞，洞裏邊墻四面有洞，是個迷宮，迷宮可以拿5樣東西!走法如下（每次都要回到門口才行）：
第1個道具：右-下
第2個道具：右-上-下-上
第3個道具：右-上-下-下-右-右
第4個道具：右-上-下-下-右-左-下-左
第5個道具：右-上-下-下-右-左-下-右-上
走到第5個時會遇到壹個女孩，然後把妳帶回家，發生談話。之後來到如圖地方，和這個人說話，別忘記拿走下面的道具。然後回到島上坐船去6號島。
6號島：到了6號島，進入PC，就看見小茂。和島上的人談話得知，在小島南面有壹扇門無法打開，於是就來到門前。調查那扇門，會出現象形文字（如圖），經過研究，知道可以用斬樹使門打開。進門後，在最深處找到壹塊藍寶石，這時候火箭隊壹研究員沖過來，把它搶走了……
為了追蹤藍寶石，於是返回5號島。這時候就可以進入火箭隊的研究所（如圖），打敗研究員後就可以奪回藍寶石。過後帶著藍寶石回到1號島的PC屋，將之交給博士。博士就會把通訊機器修理好，現在就可以和寶石版以及NGC的競技場通訊了……劇情進行到這裏，就可以進入超夢山洞了，不過先別著急，還是先坐船到7號島。
7號島：到達之後往上走，用沖浪，再往上走，上岸之後來到戰鬥塔。打過4層之後到頂和這個人對話，中途可以回到1層加血。南面的遺跡裏可以捉到No.201安儂。
最後回到華藍市，在左邊山洞口擋路的人已經讓開了，進入最深處捕捉超夢吧，有Lv70哦^_^
要到8、9號島，壹定需要神秘船票。或者輸入金手指代碼02031CF0:3a02，9號島的；02031CF0:0002，8號島的。兩條金手指分別輸入，切記，到達後壹定要關閉金手指！
8號島：這個小島上有個山洞，沿著山洞的路進去，直到看到壹分岔口。往左走，上樓梯，就可以看到壹只鳳凰（Lv70）；往右走，下樓梯，就可以看到壹只洛奇亞（Lv70）。
9號島：這個小島除了壹個謎題之外就沒有任何東西了。妳需要做的就是調查那個三角形樣的東西，直到它變成紅色，這個過程需要最短路程完成，否則就要重新開始。只要妳走過去，碰最靠近妳的那壹邊，就可以很容易地完成。當它變成紅色的時候，小島就會搖晃，No.386就會出現，收復它吧^_^