軍機處，清代官署名。亦稱“軍機房”、“總理處”。是清朝中後期的中樞權力機關。
雍正七年（1729），因用兵西北，以內閣在太和門外，恐漏瀉機密，始於隆宗門內設置軍機房，選內閣中謹密者入值繕寫，以為處理緊急軍務之用，輔佐皇帝處理政務。十年（1732），改稱“辦理軍機處”，簡稱“軍機處”。
軍機處的設立是清代中樞機構的重大變革，標誌著清代君主集權發展到了頂點。軍機處成立於雍正七年(1729年)，初名“軍機房”，不久改稱“辦理軍機處”，乾隆以後省去“辦理”二字，遂簡稱為“軍機處”了。軍機處本為辦理軍機事務而設，但因它便於發揮君主專制獨裁，所以壹旦出現之後，便被皇帝抓往不放，不但常設不廢，而且其職權愈來愈擴大。軍機處的職官有軍機大臣，俗稱“大軍機”，有軍機章京，俗稱“小軍機”。軍機大臣由皇帝從滿、漢大學士、尚書、侍郎等官員內特選，有些也由軍機章京升任。軍機大臣之任命，其名目為“軍機處行走”，或“軍機大臣上行走”。所謂“行走者”，即入值辦事之意。軍機大臣沒有定額，軍機處初設時為三人，以後增加到四、五人至八、九人，最多至十壹人。軍機章京初無定額，至嘉慶初年，始定為滿、漢章京各十六人，***三十二人，滿、漢章京又各分兩班值班，每班八人。軍機章京之任命，或稱為“軍機司員上行走”，或稱為“軍機章京上行走”。
軍機處成立後，議政王大臣會議於乾隆五十六年(1791年)廢止了，內閣變成只是辦理例行事務的機構，壹切機密大政均歸於軍機處辦理。軍機處總攬軍、政大權二端，真正成為執政的最高國家機關。軍機大臣無日不被召見，無日不承命辦事，出沒於宮廷之間。皇帝行動所到的地方，軍機大巨也無不隨從在側。但軍機處完全置於皇帝的直接掌握之下，等於皇帝的私人秘書處。軍機處在權力上是執政的最高國家機關，而在形式上始終處於臨時機構的地位，不像正式國家機關的樣子。軍機處辦公的地方不稱衙署，僅稱“值房”。軍機大臣的值房稱為“軍機堂”，初僅板屋數間，後來才改建瓦屋。軍機章京的值房，最初僅屋壹間半、後來才有屋五間。軍機處也無專官，軍機大臣、軍機章京都是以原官兼職，皇帝可以隨時令其離開軍機處，回本衙門。軍機大臣既無品級，也無俸祿。軍機大臣之任命，並無制度上的規定可供遵循，完全出於皇帝的自由意誌。軍機大臣的職務也沒有制度上的規定，壹切都是皇帝臨時交辦的，所以軍機大臣只是承旨辦事而已。“只供傳述繕撰，而不能稍有贊畫於其間”，這些都說明軍機處是皇帝集權的最好的工具。
軍機處的保密制度
軍機處職掌著每日晉見皇帝，***商處理軍國大事，並奉旨對各部門各地方負責官員發布指示的重要使命，因此它在清廷中具有舉足輕重的地位。
但是，軍機處在清代初設階段，由於無保密制度。時有部院官以啟事畫稿為名，偵探消息傳播街市，目為新聞。造成清廷許多軍國要事的嚴重泄密，其後果是可想而知的。這嚴酷的教訓，使清代軍機處不得不對保密規制進行強行規定。據清吳振木或《養吉齋叢錄》載：軍機處自清朝嘉慶以後其保密規制始嚴，規定凡軍機大臣只準在軍機處輸本日所奉諭旨，部院稿案不準在軍機處輸，司員不準至軍機處啟事，軍機章京辦事處（章京系專職辦事官員）不許閑人窺視，王以下及文武大臣不準至軍機處與軍機大臣談論。至於通諭王公大臣之事，在乾清門階下傳述，不許在軍機處傳述。並命科道官壹人輪日至隆宗門內糾察。與此同時，軍機處所收到的各類奏折和皇帝石朱批的諭旨，都有壹整套嚴格的保密管理規定，每日奏折，於寅卯二時發下，由軍機章京分送各軍機大臣互閱。凡皇帝在奏折上批有“另有旨”、“即有旨”的奏折，由軍機處章京貯於專門的保密奏折，由軍機處章京貯於專門的保密黃匣中，交軍機大臣捧入請旨，然後由軍機大臣根據皇帝的旨意，命軍機章京起草諭旨，經皇帝石朱筆改定後，交各部院速議速辦。為防止文件在傳遞過程中的失密，由軍機處將文件密封後交兵部捷報處遞往。
在文件的封袋上，分別規定右書“辦理軍機處封”，左書“某處某官開拆”，至於皇帝親筆改定的諭旨，在封袋上，則居中大書“傳諭某處某官開拆”，其封口及書年月日處皆鈐印……。除此之外，皆使領者（領取文件者）註明畫押於簿中，謂之“交友”。這可謂保密責任到人了。
清軍機處還實行了嚴格的歸檔保密規定，值日章京……凡本日所奉諭旨，所遞片單，均鈔釘成冊，按日遞添，月壹換，謂之“清檔”。凡發交之折片，由內閣等處交還及匯存本處者，每日為壹束，每半月為壹包……均責成章京檢覆無訛，按季清檔，月折及各種存貯要件，收入櫃中，值日者親手題封，謂之“封櫃”。清軍機處還設有專門的檔案房，有專職的保密人員管理這些檔案，由此而使軍機處的保密工作做得非常之好，同時，為後代留下了許多難得的珍貴史料。 軍機處的建立,標誌著我國封建君主集權的進壹步強化。
軍機處的效率
軍機處的辦事效率很高。根據內閣制度，下屬官員有事題奏，或皇帝頒發詔旨，都是經過層層機構，輾轉交送，常常要花費很多時間。軍機處則不然，壹切均由大臣和章京通同辦理，皇帝有諭，隨時奉詔承辦，而且必須當日事當日畢。在通常情況下，軍機大臣每日早5點左右進宮應召覲見皇帝，有時壹天召見數次，主要是承受諭旨，然後回堂擬寫。起先由大臣親自主稿，後來才改由章京起草，大臣擬定。經皇帝認可後，按照諭旨的性質分“明發上諭”和“廷寄上諭”兩種形式向下傳達。明發上諭指交內閣發抄，宣示天下。廷寄上諭因奏請而降旨，事屬機密，由軍機大臣直接密寄具奏人。廷寄需封入信函，交兵部加封，發驛馳遞，根據事情的緩急，或馬上飛遞，即日行300裏，或400裏，或500裏，或600裏加急，壹律由軍機章京在封函上註明。封口及年月日處，加蓋“辦理軍機處”銀印。如遇特別機密緊要的密諭件，則由軍機大臣自行繕寫封固，上寫“軍機大臣密寄”。這壹套廷寄制度，減少了很多中間環節，大大加快了辦事速度。
軍機處的日常工作
1、發折：奏事處將官員奏折下發軍機處。
2、接折：軍機章京將奏折送軍機大臣閱。
3、見面；軍機大臣將奏折送皇帝處請旨。
4、述旨：將皇帝旨意擬成諭旨再交皇帝禦覽。
5、過朱：皇帝朱筆改定奏折。
6、交發：將諭旨下發有關衙門實施。
7：開面：諭旨以年月日為序抄錄備案。
8、交折：將原奏折交內奏事處。
9、月折：將奏折復本每月壹編。
10、隨手：將諭旨、奏折重點二季壹編。
11、封櫃：將月折、隨手檔收櫃題封。