傳說有壹塊魔石,能吸取天地能量。當魔石的能量吸收到壹宣傳海報定程度,它將就擁有強大的能量, 而被它吸走能量的物體則會消失。
宇宙海盜迪恩為了稱霸宇宙,找到了魔石,並利用這塊魔石入侵了天蛇星。在對抗迪恩的過程中,天蛇星少主繆斯被潘多拉魔石吸走了大量的力量,虛弱不堪。為了讓她恢復力量,繆斯的哥哥耶裏梅斯在宇宙中苦苦尋找了多年,終於在湖底發現了壹塊能與魔石對抗的正氣之鐵,並發誓要將它打造成壹柄曠世神劍。
可是,耶裏梅斯所做的這壹切卻被迪恩發現了。為了能夠成功打造出神劍,耶裏梅斯偷偷離開天蛇星,隱居起來。另壹方面,繆斯苦苦尋找耶裏梅斯的下落,而迪恩則繼續利用魔石無惡不作。宇宙的黑暗時代來臨,直到煞魔聖劍鑄成。
宇宙海盜入侵棱石星。為了徹底瓦解宇宙海盜,戰神聯盟閃電集結,可是,在與迪恩的戰鬥中,雷伊,卡修斯,布萊克紛紛被吸進了魔石裏,只有蓋亞被雷伊用能量震開幸免於難。
與此同時,賽爾號也偵察到這股強大的能量波異動,懷疑是海盜在試驗毀滅星球的武器。為了立功,阿鐵打冒充羅傑船長偷偷攔下消息,並和賽小息還有卡璐璐壹塊兒悄悄執行這次危險任務。在與宇宙海盜的對抗中,三人不敵,陷入危險,幸虧蓋亞趕到救了他們並成功劫走潘多拉魔石。
為了奪回魔石,迪恩派出了宇宙頂尖殺手——賞金獵人摩哥斯,追殺他們。而另壹邊,賽小息他們也得知了雷伊、卡修斯和布萊克遇難的消息,在逃亡中,他們遇到了壹個自稱繆斯的神秘女精靈,據說只有她哥哥耶裏梅斯親手制作的煞魔聖劍才能對抗潘多拉魔石。
繆斯為SPT小隊指明了方向,但也將他們壹行人帶上了更加危險的旅程;邪惡的海盜、危險的叢林、亡命的追逐戰 。