顯示錯誤： 1.當英迪從地窖裏逃出去，推開墻上的壹塊大石頭，石塊落在地面上的時候往上彈了起來。 2.在爆炸的卡車底部裝有壹根竿子，這樣就能讓它翻過來。 3.在英迪和眼鏡蛇之間的玻璃墻。這點在2003年版本的DVD中被擦掉了。 4.貝洛奇的汽車司機在貝洛奇打他之前，先退縮了。 5.在卡車下面挖好了溝渠，這樣就能讓英迪從下面滑過去。 時代錯誤： 1.(德國)施邁瑟式的機械槍--電影中多處地方使用到的半自動槍，型號是MP-40(1940年款式的)；德國人用的手槍是P-38(1938年款式的)，都不可能使用於1936年。 2.顯示英迪飛行路線的地圖包含有泰國，這在當時應該被稱為暹羅(泰國的舊稱)。 工作人員可見：英迪把墻上的石塊推開準備從地窖逃出去的時候，從外部有壹個特寫鏡頭是正在被推出去的石塊的。在下壹個畫面中，當英迪和馬裏恩爬出去的時候，可以看到在前壹個場景的遠景位置有壹個工作人員蹲在那裏(可能是攝影師)。 劇情漏洞：1936年埃及是在英國的統治之下，德國人不可能像影片中那樣展開大規模的軍事行動。此外，在美劇《生活大爆炸》第七季第四集中，謝爾頓（Sheldon）的女朋友艾米（Amy）評論《奪寶奇兵1：法櫃奇兵》有情節漏洞：“主角印第安納·瓊斯的存在對電影的結局沒有任何影響。就算把他從故事裏刪掉，電影結局也不會有任何差別......就算電影裏沒他，納粹還是會找到法櫃、送上孤島、打開法櫃然後死光光，跟有他的版本壹樣。”（“Indiana Jones palys no role in the outcome of the story. If he weren't in the film, it would turn out exactly the same......if he weren't in the movie, the Nazis would have still found the ark, taken it to the island, opened it up and all died, just like they did.”）
連貫性： 1.在英迪被圍困於Well of Souls之後，貝洛奇的帽子從他的頭上跳到了地面上。 2.在卡車追逐場景之間，德國士兵擊中了印第安那的手臂，他好幾次打中了他，在德國士兵的手指上有的時候看到英迪的血，有的時候又消失了。 3.印第安納騎著馬飛躍上德國人的駕駛座的門上時，他原先騎的馬還在車旁邊奔跑，可下壹個鏡頭，這匹馬就消失了。 事實錯誤：在Well of the Souls裏面的蛇來自世界各個不同的地方。 地理錯誤：在開始的場景中，可以在秘魯的叢林中聽到壹些並不是南美本土的鳥叫聲，更像是笑翠鳥(澳洲本土的壹種鳥)。