影片既將結束的時候，又回到了影片的開端：男主角埃文跑進他的醫生的辦公室（此時他的日記不復存在），想通過家庭電影的畫面最後壹次改變歷史。在這裏，導演壹***安排了四個結尾。
導演版生命開端時：埃文看到的家庭電影是埃文的母親即將產下埃文，進入歷史的埃文決定自己結束這壹切，他用雙手掐住了臍帶，結束了自己剛要開始的生命，現實的生活中沒有埃文，凱利跟湯米被離婚後的壹母親監護，遠離了那個變態父親，自然也就沒有了雷管事件。而這個時候埃文的父親已經進入精神病院，所以結尾出現她的母親抱著的小孩子，其實是他母親再婚後生下的，旁白有說“在妳出生前，我流產過三次”，是指之前流產的兩個孩子和埃文。最後這個世界只剩下精神病院裏的詹森（埃文的父親）擁有這種能力了。
其實這個導演版結局才是原本劇本的最終結局，它使為愛而犧牲的主題更顯崇高和偉大，而且更為淒美感人。但後來由於新線公司擔心這個驚世駭俗的結局裏情節和畫面會引起部分公眾和輿論的不安，因此最後公映時被改為現時劇場版的那個。
劇場版各自成長、各走各的人生路，是埃文看到的家庭電影是第壹次認識凱莉的聚會，回到從前的埃文罵了凱莉，他與凱莉沒有成為好朋友，凱莉跟湯米的監護權也由母親得到。工作後的埃文在街上偶遇凱莉，但卻沒有相認。
另兩個結局也是按劇場版的結局設定的，《蝴蝶效應》劇場版的另外壹個結局： 尾隨（55秒），埃文遇到凱利後，返身去追凱利。