《藍色骨頭》是壹部自身就帶著叛逆氣質的電影，它叛逆到在片頭打出片名《迷失的季節》，而在片尾處才將其推翻，改為《藍色骨頭》，影片用這樣壹種形式揭示了鐘華心態的轉變，這是壹部講述他如何經歷壹番心路歷程，走出迷失的季節，肯定藍色的骨頭的故事。
影片中主要人物的處境都可以用“錯位”兩個字概括，這種錯位在影片開始處鐘振清那把間諜手槍上就已經有所體現，可用於拍照的手槍是多麽荒唐的東西，監視偵查中的偷拍要求很強的隱蔽性，而手槍是壹種極具攻擊性的、很容易引起警覺的東西，現實中這兩種東西根本不會結合到壹起。
但在《藍色骨頭》裏它們的結合暗喻了劇中人物的處境。母親施堰萍是個錯位的人，她討厭讓她感到被動的男人，卻被安排了壹段只能被動的戀情；她願意通過自己的雙手創造財富，卻只是因為漂亮的外表而被選擇；她愛上壹個纏綿中有剛毅的男人，卻無法得到回應。
她身處壹個迷失的季節，卻向往外面的世界……用鐘華的話說，她簡直就是中國最早的嬉皮士，她用自己微薄的力量反抗那個現實，追求孫洪，聽搖滾樂，和領導嗆聲……她的反抗最終讓她被現實放逐。父親鐘振清也是個錯位的人，作為特工，他的工作在暗處，目標在明處。
這與他喜歡的施堰萍已是互相反著的；他的人生觀也是錯位的，活著在暗處，死亡在明處，在暗處藏了壹輩子的特工內心深處渴望壹個舞臺，渴望壹次表演，於是他為自己預先安排了壹個英雄的葬禮，他把死亡當作了壹次燈火輝煌表演，用生命向體內的癌細胞宣戰。
因為他的生命是癌細胞賴以生存的土壤，他死後癌細胞也就什麽都不是了。鐘華完美繼承了母親的藝術才華和叛逆精神以及父親的特工素質，他覺得自己不屬於當下的時空，因為這是個“鳥要遊泳魚要飛的”亂套了的時代，他唯壹看中的是自己壹身藍色的錚錚傲骨。
而這藍色的骨頭卻不能在現實中餵飽他的肚子、治愈父親的疾病，1980年的那個夜晚給他的心理留下了創傷，他誤認為父母吵架的原因是因為自己偷玩了父親的手槍，這使他背負著內疚和彌合父母關系的責任直至長大成人，因此他不能承認自己被現實放逐。
因為這樣等於承認了自己是壹個廢物，而如果承認了自己是個廢物，那麽他父母的結合就真的毫無意義了。然而母親的故事讓他觸摸到了壹個遙遠陌生而又熟悉的靈魂，這靈魂裏的叛逆與自己有幾分相像。
這使他意識到，證明在錯位的時空裏生存的可能性與實現叛逆的價值或許才是彌合父母關系最好的方法，於是那首叫《藍色骨頭》的歌曲誕生了，在《迷失的季節》的伴唱中，鐘華向世界、向父母高喊出了自己的宣言與痛楚，“太可惜也太可氣”變成了“並不可惜也並不可氣”。
春天的花朵也重新長回到了春天裏，鐘華借由這首歌選擇了接受當下這個無從選擇的時空，但要憑壹身理性與智慧的藍色骨頭傲然屹立，追求自己想要的幸福。