影片故事發生在1614年,正值德川家康統壹日本,結束了諸侯割據的戰國時代,建立了幕府統治體制。為了鞏固政權,德川家康決定消滅具有潛在威脅性的忍者勢力。此時日本兩個最著名的忍者村落分別是卍谷的甲賀和鍔隱谷的伊賀。400年來兩個村落壹直處於敵對狀態。為了維護和平,雙方祖先曾訂立了約定,互不往來但定期比武決勝負。壹個偶然的機遇,兩個忍者村落的繼承人朧(仲間由紀惠飾)與弦之介(小田切讓飾)在不知彼此身份之下相識,進而墜入情網,但殊不知,等待他們的卻是無可抗拒的悲慘宿命。
德川家康展開政治密謀,廢止了伊賀與甲賀之間的和平約定,並以選擇幕府的下任統治者為由,命令兩個村落間各派出五名最優秀的忍者進行對戰。十名忍者個個身懷絕技,更擁有特殊的超能力,將開始壹場生死大對決。朧與弦之介成為這壹陰謀下的犧牲品,為了各自家族的榮譽而被迫成為敵人,掙紮在愛情與仇恨的邊緣。就在十名忍者踏上死亡征程的同時,幕府的大軍悄悄開進位於深山中的兩個村落,將大炮對準了無辜的居民……