距離第壹部很多年後，次界由大和王子的後人大和管理，當中有壹座時間塔，由天使昂斯和守護天使麥高看守，惡魔麥昆認為時間塔有寶物而偷跑進去，昂斯和麥高在追捕麥昆其間碰上被封在這裏的史巴謝斯(又名超級宙斯)，並在時間壺中看到未來次界被洪水淹沒，結果昂斯、麥高和麥昆，以及從時間壺走出來的寶芝，壹起展開尋找十二顆聖寶石拯救次界的旅程。只是… 因為通信問題，大和只知道麥高等人偷看時間壺，而不知道次界會被洪水淹沒，結果派出了手下五侍女出動追捕，另壹方面，復活了的惡魔首領史巴地比(超級惡魔)也在全力阻止他們拯救次界… 鳳凰武士開始被香港改譯成超聖鳳凰，並在外傳故事出場。