《禦賜小仵作》劇情分集介紹：
第1集
天已經黑了，電閃雷鳴，壹個男子走在樹林裏，手提燈籠，背著筐簍。男子在樹下停下，壹手扶著樹，沒想到被雷劈中，倒在地上，燈籠燒了起來。唐中晚期，有宦官扶持宣宗上位，禁軍神策軍由宦官掌管。宣宗特設三法司，讓安郡王蕭瑾瑜統管天下刑獄事務。?
第2集
接下來的考試是驗傷，活屍體拉肚子了，楚楚在外面等，看到蕭瑾瑜過來頭上有傷，拉上他就進去。楚楚把受傷的情況的說清楚了，還想脫了他的衣服看。蕭瑾瑜制止了，亮明了身份，楚楚嚇得跪在地上磕頭。蕭瑾瑜通過她身上的氣味以及驗屍手法，表示她是出自仵作世家，並非書香門第。?
第3集
楚楚在街上撞到壹個瘸腿的人，男人讓她送自己回去，結果到了偏僻的小巷，男人拿出匕首架在楚楚脖子上，要她交出墜子。吳江帶著壹隊侍衛趕來救下楚楚，男人卻被滅口。?
第4集
楚楚換上侍女的衣服，蕭瑾瑜教她禮儀。楚楚差點摔倒，蕭瑾瑜抱住他，楚楚趁機看他胸口，發現沒有傷很是奇怪，玉面判官的胸口明明有道傷的。楚楚跟著蕭瑾瑜他們來馮府，還遇到了西平公主的侍女半夏。?
第5集
楚楚發現蕭瑾瑜住所裏有審訊室和驗屍房，和玉面判官住的壹樣，更加疑惑。蕭瑾瑜得知這些是楚楚在六歲時聽到的故事，可是自己那時候也是個幼童，楚楚覺得也有道理。楚楚將六扇門九大神捕傳奇的冊子給蕭瑾瑜看，蕭瑾瑜發現這些都是父親當年辦過的案子。?
第6集
楚楚覺得玉面判官說過了，只要能恢復原樣就可以驗，她還提前準備了和馮尚書壹樣的發冠，保證不會讓人看出來。蕭瑾瑜追問石頭墜子和玉面判官之間的關系，景翊突然過來，只能作罷。?
第7集
蕭瑾瑜送楚楚回三法司，問她繡了什麽，楚楚說是人體左側第五根肋骨，是最貼近心臟的地方，把手放在這裏就會聽到心臟怦怦跳。蕭瑾瑜要去公主府，看著手帕忍不住笑起來。蕭瑾瑜陪著西平公主吃了飯，說了昨天的事情，問她關於父親的情況。西平公主得知有人監視公主府，很是驚訝。
第8集
冷月告訴蕭瑾瑜，她問了所有江湖朋友，依然沒有打聽到有關玉面判官的事情，但她打聽到楚家人對楚楚十分珍視，不像是壹個私生女。楚楚填好驗屍單來找蕭瑾瑜，正好看到冷月拿著蕭瑾瑜的帕子擦手，忍不住將手裏的驗屍單揉成團。?
第9集
皇帝答應給賞賜，冷月說要讓孫明德給她牽馬繞著皇宮走壹圈，皇帝同意了。吳江給蕭瑾瑜匯報驗屍結果，蕭瑾瑜讓他把過所還給楚楚，覺得楚楚不會離開。薛汝成把從馮府撿到的驗屍工具給蕭瑾瑜，幸好馮府的人不認識這些，不然平添麻煩。?
第10集
景夫人來找西平公主，覺得蕭瑾瑜和冷月壹起長大，想必是兩情相悅，不如去找皇帝賜婚。西平公主表示蕭瑾瑜公務繁忙，暫時沒有這個心思。景夫人回來找景閣老發火，不明白他為什麽要撮合蕭瑾瑜和冷月，景閣老只說自有打算。?
第11集
蕭瑾瑜表明自己的身份，說是長安掌管刑獄的大官，壹開始楚家人並不相信，蕭瑾瑜說出兩個發生在關嶺縣的案子，還說了上面寫的批文，楚家人終於信了。蕭瑾瑜跟他們打聽巫醫，楚平表示巫醫雙腿不便，大家嫌棄他晦氣不願意往來，只有楚楚經常給他送東西。?
第12集
楚楚查驗壹番，這人天根已斷，隨身攜帶內侍省的牌子，應該是個宦官。死者身邊的長柱物體正是作案兇器，致命傷是從下往上，讓楚楚很是疑惑。楚楚和蕭瑾瑜模擬壹番，發現兇手高度像是個孩子，但孩子也不會有這麽大的力氣，很有可能是個雙腿殘疾的成年人，應該就是巫醫大叔。?
第13集
秦欒得知許如歸刺殺失敗，氣得不行。新任黔州進奏使沈余調查銅錢私鑄案，秦欒讓周翰盯緊他，讓孫明德密切監視西平公主府和薛府景府。蕭瑾瑜吐血暈倒，楚楚很是擔心，跟楚爺爺說了蕭瑾瑜的真實身份。楚爺爺得知蕭瑾瑜是安郡王，很是擔心，要為楚楚承擔，楚楚決定獨自承擔。
第14集
薛汝成是武宗嫡出，當今皇帝是他父皇的叔叔，他穿著龍袍站在鏡子前，他壹直隱忍，為的就是有壹天能重新奪回江山。景翊要將藏在巫醫院子裏的幹屍運回縣衙，去找蕭瑾璃借兵，還跟楚家人要了棺材，假借運東西，把屍體帶回去。蕭瑾瑜帶著景翊他們到縣衙，關嶺縣縣令鄭有德連忙迎出來，為昨晚醉酒請罪。?
第15集
楚楚決定根據頭骨和自己的長相，推斷出母親的樣貌，用陶土捏出母親的大致輪廓，來尋找親生父親。蕭瑾瑜答應了，讓她盡管去做。景翊蒙面躲在樹後偷看，不小心發出動靜被侍衛發現，匆匆忙忙跑了。景翊傳信給景閣老，說了蕭瑾瑜發現宦官屍首的事情。
第16集
蕭瑾瑜找不到楚楚，十分著急，去找景翊質問。景翊承認跟蹤蕭瑾瑜到鬼宅，在後山偷看驗屍，但這是為了保護蕭瑾瑜的安全。景翊將景閣老寄來的信件交給蕭瑾瑜，兩個人冷靜下來。景翊看了許氏遺留的衣物和首飾，覺得衣服上的蜀繡不是尋常繡娘手藝，是出自官家，許氏應該是官宦家眷。?
第17集
許如歸故意說出楚楚親生父母的身份，就是想要破壞蕭瑾瑜和楚楚的關系，畢竟現在楚楚是逆黨遺後，但蕭瑾瑜並沒有中計。蕭瑾瑜想起嚴明的死，想到他的手劄，發現他也是在找昌王的蹤跡。秦欒將小太監散播謠言的事告訴皇帝，覺得可以給武宗諸子加封謚號，這樣既能彰顯仁德，也能讓流言不攻自破。?
第18集
蕭瑾瑜通過楚楚的幫助看到墻面滲透的光孔，覺得蕭恒是用光標註地點的方法，留下了線索。侍衛來報楚家出事了，蕭瑾瑜趕過去，發現許如歸的繩子是用楚河做木工的工具磨斷的，得知楚河和許如歸待過壹段時間，壹定就是那個時候把工具給他的，只是不明白為什麽楚河要幫他。?
第19集
蕭瑾璃趕緊帶走楚楚，景翊發現蕭瑾瑜的心思，忍不住取笑他。楚楚不明白蕭瑾瑜為什麽這麽生氣，蕭瑾璃也說不清楚。正好譚貴過來，想要和楚楚借壹步說話，楚楚答應了。譚貴想要了解當日父親遇害詳情，楚楚很是猶豫，譚貴表示身為人子想要問清楚，不然無法和母親交代，想要下跪求楚楚。?
第20集
蕭瑾瑜要譚貴暫緩刺殺楚楚，將個中情由告知景閣老，譚貴答應了，提出要跟他們壹起去。楚河挨了板子，楚楚去看他，蕭瑾瑜拿著傷藥過來，聽到他們的話，很是失落。楚河現在放下了，把楚楚當成妹妹。蕭瑾璃看到蕭瑾瑜胃疼，幹脆打橫抱他回房間。?
第21集
西平公主陪伴唐宣宗遊園，想到了駙馬。當年她和駙馬定情，駙馬給的是自家院子邊的壹對石頭。蕭恒表示自己希望做公主身邊的壹方磐石，壹直護衛公主。西平公主希望皇帝能取消冷月和蕭瑾璃的婚事，皇帝拒絕了，斥責西平公主身為皇族卻不知分寸，讓她要記得蕭瑾璃的身份。?
第22集
因為蕭恒受了重傷，五年前自知時日無多，留下陳情書，和屍體埋在沼澤裏，等待有人能找到他，沈冤昭雪的那壹天。黔州刺史李璋來拜見薛汝成，薛汝成以昌王的身份和他見面，得知蕭瑾瑜把私鑄銅錢的案子交給他，讓他要萬事小心。楚楚在蕭恒身上找到文宗帝的密旨，可以證明陳瓔不是謀反。?
第23集
薛汝成勸蕭瑾瑜放棄楚楚，畢竟她是個仵作，如今還是個逆黨遺後，兩個人的身份地位差距太大，是不可能在壹起的。蕭瑾瑜表示薛汝成自己就是寒門出身，壹路辛苦到了現在的身份地位。薛汝成從小教導他不以身份待人，楚楚的經歷讓她成為現在的模樣，他十分珍惜，也不會讓人帶走楚楚，今天他說的話和教導相悖，自己不會聽。?
第24集
私鑄銅錢案事關重大，蕭瑾瑜認為李璋必定參與其中，楚楚跟他說了李璋手上有細小傷口的事，讓他更是肯定，但沒有直接證據。?
第25集
李璋看蕭瑾瑜說出來了，也不再掩飾，壹聲令下，洞外傳來爆炸的聲響，周圍石洞隨機崩塌。蕭瑾瑜下意識護住楚楚，李璋掏出匕首刺來，三個人被掉落的石頭堵在了另壹邊。蕭瑾瑜和李璋打起來，楚楚搬起石頭砸暈了李璋。蕭瑾瑜吸了很多迷煙，加上這裏是密閉的空間，繼讓蕭瑾瑜產生幻覺，就像是沈進水裏。?
第26集
冷將軍收到孫女冷月的來信，是壹封普通家書，但他知道冷月不會給他寫信，很是疑惑。薛汝成回京遇到了刺客，被刺客劃傷了手臂。刺史府在昨夜突然著火，屬下來報說有人看到是西南節度使官兵。?
第27集
秦欒明白這是有人和他作對，讓孫明德盡快查清楚。周翰在博古齋沒能查到什麽，讓秦欒很是不滿。好在周翰知道了當年公主府遣散的人，壹個是丫鬟壹個是乳娘，已經安排好了，在回京路上了。秦欒很是高興，帶著孫明德前往薛府，說是去探望，其實是去試探，還故意抓著薛汝成手臂，讓他的傷口開裂流血。?
第28集
蕭瑾璃來找蕭瑾瑜，他去查了軍中外出的人員名單，蕭瑾瑜發現有奇怪的地方。這段時間還有幾個逃兵，是收編進來的幾名賊匪，都在侯斌手下受訓，還不到四個月。冷月潛入冷將軍房中，翻找壹番，找到藏在盒子裏的書信。冷將軍從外面回來，發現房間裏有人，拿了劍出來要打，看到是冷月連忙收手。?
第29集
蕭瑾璃來找蕭瑾瑜，他去查了軍中外出的人員名單，蕭瑾瑜發現有奇怪的地方。這段時間還有幾個逃兵，是收編進來的幾名賊匪，都在侯斌手下受訓，還不到四個月。冷月潛入冷將軍房中，翻找壹番，找到藏在盒子裏的書信。冷將軍從外面回來，發現房間裏有人，拿了劍出來要打，看到是冷月連忙收手。?
第30集
冷大將軍說艾條是吳琛建議他用的，也是他去采買的，幾個人去吳琛房間，發現他已經不在了。蕭瑾瑜證實自己的猜測，下毒之人就是吳琛，毒是在蜣螂罐子裏。蕭瑾璃查到幾個死者家裏的情況，他們家人出事的時候自己都不在身邊，因此十分愧疚。冷沛山派人去找吳琛，找了壹夜，最後發現在水井裏。?
第31集
吳琛營房裏有兩份相同的賬本，每次采購物資都是雙份，但是最後的總數是對的上的，蕭瑾瑜明白過來是用假錢買的，從賬中撥出真錢去買東西，再用假錢給將士們發軍餉，所以當初蕭瑾璃拿出的錢才會有大半是假錢。因為剛剛出事，如果再從將士們手裏拿回假錢，想必會生亂。?
第32集
秦欒尋回舊人，要拿孩子做文章，西平公主沒辦法，只能把真相告訴景閣老，讓他幫忙。原來當年出事，陳瓔夫人服下催產藥，生下兒子就去世了。陳府家奴抱著孩子來求西平公主，稚子無辜，西平公主收養孩子，對外說是雙生子。?
第33集
脈案記錄著西平公主的孕期情況，看得出當年公主僅懷壹胎，卻謊稱有兩子。蕭瑾瑜帶著楚楚來調查張樞死因，韓績要捉拿楚楚，蕭瑾瑜拿出楚楚是三法司仵作的憑證，韓績沒有資格帶走楚楚，只能走了。?
第34集
楚楚呈上宦官死者隨身攜帶的腰牌，是內侍的腰牌，就是歸秦欒所管。秦欒還想辯解，但在蕭瑾瑜的指責下也無話可說。皇帝讓人將秦欒押入大牢，免去韓績刑部尚書之職，連降兩級，閉門思過半月。韓績明白是受奸人蒙蔽，身為刑官卻不能明辨是非，跟蕭瑾瑜道歉。?
第35集
冷月來到冷府門前，景翊過來陪著冷月回家，拿出冷將軍給的鑰匙，打開了門。冷月看到這裏的樣子，想念著父母，也明白了爺爺不願意回來的原因，畢竟這裏都是回憶，觸景傷情。?
第36集
蕭瑾瑜覺得許如歸吞食的藥丸有問題，楚楚決定剖開許如歸的肚子取出來，表示壹定不會有生命危險，讓冷月幫她。蕭瑾瑜和景翊根據許如歸的描述，推斷他們聚集的地方。楚楚取出了許如歸肚子裏的丸子，看著是個面筋，外面是蓖麻子毒，裏面是和胡蔓草煉過的水銀。?