犯人到底是單獨還是團夥行動到現在還是個謎。調查中重點有下面的嫌疑人。
立川組的少年
立川組是當時立川市的少年竊車團夥（立川市在府中市西面）。
少年S
立川組的小頭目。當時19歲。
被懷疑理由
偷車的方法和發現的被盜車上的痕跡吻合。
熟悉當地地形，懂得汽車和摩托車的駕駛。
和1968年3月在立川市壹家超市用煙霧彈搶劫的犯人關系很好[7]。
其父正是騎摩托的警察，因此有警用摩托的知識。
除了家人的證詞以外無法提供不在場證明。
事發前說過要搶劫東芝或日立的運鈔車。
但是，也有不符合的地方，如果是單獨犯罪少年S就被排除。
血型是A，恐嚇信貼郵票的血型是B。
和恐嚇信上的筆跡不同。
多摩農協恐嚇事件中恐嚇信是8月25日寄出，這天他在少教所。
少年S案發5天後（1968年12月15日)在家中服用父親買來得氰化鉀自殺。熟悉他的人都不認為他會自殺。包氰化鉀的報紙上只有S本人和他父親的指紋。自殺後第二天，警察將當事的4個銀行職員帶到S家裏辨別面容。4人全部說S長得很像嫌疑人。據此1968年の12月21日警方以S的照片為藍本公布了模擬像。但是最後警方排除了S作案的可能。
少年Z
立川組成員。當時18歲。
懷疑理由，1，2，3和少年S相同。案發後變得很闊綽。買了新車開了公司。然而Z的血型是AB，筆跡也和恐嚇信上的不壹樣。
1975年警察在刑事訴訟時效前逮捕了Z，但是由於證據不足在刑事訴訟時效前被釋放。
男同性戀K
少年S的朋友，不是立川組成員。當時30歲左右。
除了S的親人是事發當天唯壹對S作證的人。根據K的證詞S事發2～3天前到事發當日壹直和K在新宿的公寓過夜，事發當天早上8點離開。離開時間是根據天亮的程度並沒有看表，外面下著雨，忘記了有沒有把雨傘或者雨披借給他。K還說認識S是事件發生的20天前，然而家裏卻擺著夏天和S壹起旅行拍的照片。
事件發生壹年之後，K移居國外，並在當地開了商場。再次回到日本後買了數棟公寓，事件七年後買了豪宅。
如果K是罪犯壹員的話，S在少教所時寄出的恐嚇信，現場附近目擊到的30歲男子，被盜車中留下的耳環就有了合理解釋。
但是經過調查警方也排除了K的作案嫌疑。據K自己說在國外發達是因為找到了有錢的靠山。
府中市的司機K
當時25歲。熟悉當地環境，血型也是B，會打字，從他寫給朋友的信中發現和威脅信相似的口吻，但是筆跡不同。因為長相和模擬像酷似所以從嫌疑人名單12,301位脫穎而出。
事件發生1年後的1969年12月12日，每日新聞記者對警方的采訪中，警方透露了K，但是強調筆跡不同。但是各家媒體迅速作了報道。警方怕嫌疑人逃跑，不得不馬上逮捕了K。由於毫無證據第二天K被釋放。K因此失去了工作。並且壹直受到歧視而不斷調換工作。2008年9月自殺[8]。可以說K是這個事件中唯壹的受害者。
日野市三兄弟
在日野市經營電器公司。當時分別是31歲，29歲，26歲。家裏有個大車庫能夠改裝摩托車。老二熟悉摩托車在不良組織中。做過招牌能夠噴漆，事發前買了裝有煙霧彈的新車。兄弟中事發前也有人戴過鴨舌帽。但是車上的煙霧彈和鴨舌帽和犯罪現場找到的不同。警察搜查了三兄弟的家證明和事件沒有瓜葛。
房地產公司職員
男性，當時32歲。事發前缺錢，事發後手頭寬裕。有在東芝府中上班的經歷，姐姐在東芝府中工作了12年。本人很會開車，長得又很像模擬像中的人。但是事發當天從杉並區前往橫浜途中。錢多也是因為在房地產買賣中賺了1600萬日元。最後也被排除。
公司職員P
三億日元事件發生前的1955年也運用類似的手法搶劫千代田區壹家銀行的運鈔車後被捕。P出獄曾經說過花壹年時間幹壹樁大事情，三億日元事件後他也買進了土地和進口車。經過調查錢也是通過房地產經營的合法收入。P移民夏威夷後病死。
自稱犯人的人
時效成立後壹些人自稱這次搶劫事件是自己所為。經過甄別這些人都不是真正的罪犯，目的有的是為了出名，有的是為了賣書，還有的為了詐騙。
犯人在使用煙霧彈的時候發生了故障，結果犯人用特殊的方式才使煙霧彈發煙，還有保險箱中除了現金和獎金袋之外還放了其他東西。使用何種方式使煙霧彈發煙和保險箱中所放的其他東西只有真的犯人才知道。