很詳細的隱藏+支線攻略，壹路暢通。
壹、伏魔山：
陳靖仇（主角）的師父陳輔要主角跟上他，和師父找到昆侖古鏡將其拿起來時卻喚醒了遠古魔獸－饕餮，師父要主角離開但主角不肯，於是就壹掌將主角打出，將自己和魔獸封印在洞中，告訴主角說若要救他要去雷夏澤找其師伯公山先生。到山腳下，主角喚出了符鬼，於是就踏上了旅程。
二、月河村：
在此村打聽到雷夏澤的位置，並知道村民因河神祭而禁止任何人過橋，便叫我們先去村長家休息，到村長家和於小雪第壹次見面，後來得知要15歲女童祭河神，到了大夫家知道大夫的女兒被抽中做為祭品，但小雪願意代替。因此小雪的弟弟要主角去救小雪，主角也答應了。打敗河神救出小雪後回到村裏發現河神在大肆殺戮村人，主角和小雪聯合擊敗河神，但村人不諒解，應將主角和小雪趕出村子。
三、雷夏澤：
到雷夏澤見到師伯後，知道師伯被軒轅劍所傷，無法去救師父，師伯輔和他們說拓拔氏有壹上古神器－神農鼎，其所煉之藥可救師伯，希望主角能將藥煉好帶回，但此鼎被宇文拓奪走，要主角小心。
（此處可和小女孩玩猜數字，沒有次數限制）
四、黑山鎮：
進客棧休息時突然聽到隋兵要來抓小孩給郡主養顏，主角立刻出去看，正當猶豫是否要出手時，拓拔玉兒出現將隋兵殺死但卻被妖魔化身的首領打敗，主角救將妖魔打敗救了拓拔玉兒，但玉兒非常討厭隋人，後來張烈出現並感謝主角壹行人便在客棧宴請主角，中途因隋兵出現在其部落附近於是和主角去隋軍大營。
五、大雁嶺隋軍大營：
主角壹行人將妖魔化身的隋軍首領擊敗救回北擄走的小孩。
六、大雁嶺：
到了張烈的部落打聽神農鼎的消息，後來得知被皇帝要走了，此時玉兒獨自離開去找神農鼎的下落，主角壹行人便去找玉兒的下落。
七、蘆家渡：
來到此得知皇帝在徵妃子，將所有渡河的船徵走了，於是壹行人打算用混的上船，張烈去找件隋兵衣服，主角澤找胭脂（紅色的花）發簪（拿皮靴和小女孩換）和女用衣服（拿鐵戒指和手鐲和老婆婆換），到客棧集合換完裝後便混上了船。
八、船上：
隋兵要張烈將女子送到第二廂房，主角和小雪到第二廂房打聽玉兒的消息但並未在船上，後來得知船底載了壹堆銅器，去壹探究竟時卻被公公識破，經過戰鬥後將被抓的女子都放走，並殺了公公將船奪走，開往大梁。
九、大梁：
打聽消息得知隋煬帝在此，因此主角壹行人打算混入皇帝所在的龍舟艦隊尋找神農鼎和玉兒的下落。
（推理遊戲答案－誰是王家小孩：小四）
十、龍舟艦隊：
在龍舟中發現神農鼎，但卻是假的，真的在中途被搶了，於是壹行人在裏頭尋找玉兒的下落，最後在大殿發現玉兒要行刺皇帝，後來宇文拓出現將玉兒打傷，主角將玉兒救出，皇帝下令要宇文拓將壹行人抓回。
十壹、江邊小屋：
主角將玉兒救出後在小屋昏迷了壹陣子，玉兒醒後，張烈本要帶她回北方，但玉兒得知主角在找神農鼎時，死都不回去，於是張烈先回去了。
（江邊小屋景色很美）
十二、豆子坑：
玉兒知道土匪在山上後吵著要上山，但主角建議先休息，於是到客棧，突然隋兵來搗亂，主角們出去修理他們，遇上了程咬金和秦叔寶。之後上魔王砦去，玉兒說要潛入，主角說從水路進入，但玉兒不會遊泳，壹行人道山下找竹管子，中途看到運糧車，主角提議下山找村夫讓他們躲在運糧車內混入。到山下後和小孩玩躲貓貓換竹管子，替車夫找香包，找到後他說到砦的入口找他，她回將壹行人送入砦中。
十三、魔王砦：
見到程咬金和秦叔寶後，不壹會兒，隋兵又來搗亂，過去壹看，原來是宇文拓和其部將斛律安與韓騰，他們將鼎搶走後嫁禍給主角壹行人，結果程咬金和主角打了起來，將他打敗後秦叔寶說這是宇文拓嫁禍的，玉兒說十五天內壹定將鼎找回。
十四、東萊：
打聽消息。
十五、泰山北方樹林：
遇到壹個受傷的人，將其至好帶回東萊。
十六、東萊：
打聽到泰山設了壹個奇怪的法壇。
十七、泰山：
在山上看到壹個六芒星陣，正覺怪異時，韓騰與楊碩出現，壹行人躲在壹旁只見東萊城被屠城，壹行人上前將楊碩幹掉，但鼎卻仍不知下落，主角在楊碩身上發現地圖和信，便趕往大梁了。
十八、船中：
遇到郡主獨孤寧珂也找到鼎，得到船。
（得到船後去蘆家渡尋寶：依序尋找橋頭＞大石頭＞油紙傘＞陶罐）
十九、大梁：
將救師伯的藥材買齊但尚缺肉。大夫說到西方打敗精即可取得。
（推理遊戲答案－誰說謊：呂公）
二十、魔王砦：
找到鼎煉好藥後找程咬金去，玉兒為履行諾言非要和程咬金打壹場，主角們就和程咬金和秦叔寶打了壹場。
二十壹、雷夏澤：
主角到了後發現沒有人，問垂釣老人得知師伯已病故，師伯母和他孫女到大梁了，主角便動身前往大梁。
二十二、大梁：
在街上遇到師伯孫女，去找師伯母拿到師伯遺書得知東海仙島有壹仙人可敵饕餮，師伯母要主角壹行人去找船匠將他們的改造成航海船。出海後被壹條大鯨魚吞了下去，走到深處和氏人族戰士打了起來，後來氏人族女王出來阻止，才知道他們在太古神獸（巨海）體內，女王說若替他們擊敗黑龍王就帶她們去仙島。
二十三、黑龍王宮：
打敗黑龍王卻誤摘崆峒印，使氏人族全變回原貌。
二十四、氏人國：
因玉兒誤摘崆峒印非常過意不去便自毀容貌，有失明危險，後來女王後悔責備玉兒，便送他們去仙島。
二十五、仙島：
因玉兒屢次高燒不退，主角去百草澗找草藥，找其後加上小雪的手臂肉用神農鼎熬，玉兒的病較好了，於是繼續找尋仙人，最後看到兩人在下棋，主角等了兩天終於下完，主角請求兩位仙人救師父，仙人請他們仙去天外村休息壹下。
二十六、天外村然翁居：
主角向古月仙人求救，但古月仙人不答應，仙人說玉兒的商會有生命危險要主角去東皇廟找百年地稔草救治。夜裏玉兒傷勢惡化，主角不管那麽多救沖出去找百年地稔草，小雪也去求古月仙人，古月仙人答應，但仍需要西母峰的血露蟠桃和神農鼎。
（DOMO工作室在村後井中，桃源仙境的水墨畫真的好美）
二十七、西母峰：
和蟠桃的守護神刑天對戰（必輸），發現是仙人的考驗，於是通過考驗將蟠桃帶回。
二十八、然翁居：
至好拓拔玉兒，老仙人說古月仙人要替主角救師父要他們去對奕亭，到了之後古月仙人要主角去海中建木取盤古巨斧。
二十九、海中建木：
擊敗盤古取得盤古大斧。
三十、對奕亭：
和仙人說話。
三十壹、然翁居：
睡壹覺然後以禦劍術到伏魔山。
三十二、伏魔山：
救回師父。
三十三、然翁居：
休息壹下，到對奕亭找老仙人。
三十四、對奕亭：
老仙人要他們去氏人國。
三十五、氏人國：
從女王口中得知宇文拓搶走了崆峒印。
三十六、然翁居：
玉兒位不讓神農鼎和昆侖竟被搶，提議暫放仙人那，但師父知道後和玉兒吵了起來，師父出去了，主角將他找回來。
三十七、莫支灘（坐鯨魚的地方）：
問到師父的消息。
三十八、對奕亭：
找到師父。
三十九、然翁居：
跟仙人道別，取得盤古大斧。
四十、仙界傳送點：
到人界傳送點。
四十壹、江都：
到客棧休息然後到橋上和陸先生說話，得知伏羲琴在敦煌石窟，崆峒印在長沙可得貴人相助，女媧石則飄忽不定。到長沙要經大禹水路，要主角到西方杏山茅屋找喬岱娘。
四十二、杏山：
找喬岱娘打開水路，她拜托主角去長沙替她取得瓊花種子。
四十三、長沙：
遇到獨孤郡主，得知女媧石在南嶺鬼窟，伏羲琴在河西沙漠，崆峒印在宇文拓的兩個部下手上，於是相約攻營裏應外合。
四十四、長沙隋軍大營：
和斛律安（必輸）和上官震遠對戰，擊敗上官震遠後，上官震遠從密道逃走但卻被郡主殺死奪取崆峒印。郡主給主角壹到令牌相約大興城見。
四十五、杏山：
將瓊花種子給喬岱娘。
四十六、江都：
接師父壹起去大興。
四十七、大興：
去郡王府找郡主，休息壹下後師父要主角壹行人先去找神器下落，來到太師府發現涪陵郡被毀，並下壹個目標是長沙，便決定先去長沙救人，師父奈不得就答應了。
四十八、長沙隋軍大營：
為阻止長沙大劫直接殺入大營，但沒想到和宇文拓碰上，隨後便打起來（必輸），宇文拓強迫主角交出崆峒印和神農鼎，並將師父打成重傷當作人質。
四十九、然翁居：
找仙人求助，但仙人不在。
五十、長沙隋軍大營：
用崆峒印和神農鼎換回師父。
五十壹、大興：
到郡王府內並得知女媧石在巴蜀古王墓中。
五十二、巴蜀古王墓：
跟斛律安對戰，戰勝後取得女媧石，但又被奪走送至宇文拓手中。
五十三、大興：
到郡王府得知師父已到並大發脾氣。主角們去郡主房間，但小雪身體不適，主角將送大夫請來，之後主角壹行人去皇家財寶室偷取神農鼎、崆峒印和女媧石。偷得後，小雪又將神器帶走了，郡主要主角去大興城門和玄武們問是否小雪已出城，但城門的人都說沒有，於是回到郡王府，得知小雪去了太師府，玉兒提議去太師府看看，到太師府後發現韓騰將進軍靈武，便先去郡王府交代留意小雪，隨即趕往靈武。
五十四、靈武隋軍大營：
主角發現韓騰並打了起來，可是小雪手持軒轅劍，因此，仍然無法阻止靈武被毀滅。
五十五、大興：
回到郡王府，郡主說有條通往太師府的密道，但主角已無心再和宇文拓作對了。然而郡主告訴玉兒小雪離開原因後，便在夜裏潛入太師府，希望帶回小雪，讓主角和小雪在壹起。找到小雪後，小雪和玉兒說明了宇文拓為何要收集神器並且她就是女媧石，想要留下來幫助宇文拓，玉兒將小雪的事寫成壹封信想交給主角，但是當郡主知道後便露出真面目將玉兒打成重傷並且嫁禍給小雪也將那封信燒掉了，主角此時趕到也相信郡主認為是小雪和宇文拓聯合傷害玉兒。在迫於玉兒傷重的狀況下，主角照小雪所說仙將她帶至仙人處。
五十六、然翁居：
因仙人太晚趕回，玉兒死了。
五十七、對奕亭：
古月仙人勸主角放棄，但透露出天上的伏羲宮殿中有天女白玉輪之陣可使死人復活。
五十八、然翁居：
將玉兒的水晶棺收起來。
五十九、對奕亭：
跟仙人道別。
六十、大興：
回郡王府跟郡主及師父道歉，主角已無心再戰，告別郡主後從玄武們離開了，中途和李世民相遇，並相約太原門口見。
六十壹、太原：
至唐國公家中遇見張烈，主角跟張烈說了玉兒的事。張烈加入後，壹行人先去雲崗石窟取得可以和宇文拓相抗衡的東西後再經由石窟的天路去洛陽。（若有讀過杜光庭的虬髯客傳想必會對張烈和李世民那盤棋很熟吧！原來張烈就是虬髯客）
六十二、通天塔：
主角們被困在外面無法進入，於是先回洛陽找李靖拿法器。
六十三、洛陽：
和郡主相遇，郡主說要幫忙找李靖，後來在城門碰到李靖，張烈便邀壹行人去他家，張烈將事情交代完後，便向通天塔前進了。
（張烈交代的事情是不是也很熟呢？若不是的話，去翻翻唐傳奇選這本書，找杜光庭的虬髯客傳這壹篇，很精采喔）
六十四、通天塔：
先將入口火熄滅，上塔後在大廳遇到韓騰，便打了起來，將韓騰擊敗後上到塔鼎，跟宇文拓打（第二次必輸），宇文拓將主角打敗後，郡主將小雪脅持當人質，主角就趁宇文拓不註意時將傷了他的手，但主角也因宇文拓的力量昏倒，郡主也露出真面目，原來她是撒旦的女魔將之壹。數天後，主角醒來時，小雪和主角說明了壹切，主角才恍然大悟，決定去找仙人想辦法。
六十五、然翁居：
找到了老仙人，他說他也沒辦法，叫他去莫支灘找古月仙人。
六十六、莫支灘：
古月仙人說有兩個辦法，叫主角先去找宇文拓和其它神器。
六十七、魔界中原：
在驚魂塔與蟄魂塔打敗兩個女魔頭奪回崆峒印和神農鼎後，去通天塔救宇文拓及取伏羲琴，在外面遇到程咬金和秦叔寶，但因通天塔入口被結界封住，於是先回天外村請仙人想辦法，程咬金和秦叔寶也先回營部。
六十八、然翁居：
和古月仙人壹起去通天塔壹探究竟。
六十九、通天塔：
古月仙人將魔界妖火熄滅後便吩咐分成三路前進，主角去救宇文拓，古月仙人直接至塔鼎布陣，其余的人去取伏羲琴。主角們找到宇文拓後，郡主也出現並露出真面目和主角們打起來，擊敗郡主救了宇文拓後繼續往塔頂前進。到了塔頂，看見大家都在，古月仙人叫宇文拓站在中間圓圈，小雪和其它神器放在周圍的圓圈，經過儀式，大家被送回過去，然後壹行人被傳送至虛空之門。
七十、虛空之門：
主角們在次元交錯空間中來到了伏羲神殿，發現天女白玉輪之陣，於是想將玉兒救活，但是需要伏羲琴和女媧石大量的能量，為了顧全大局，只得放棄將玉兒復活，到了赤貫星內將兩道光柱關閉，陣的傳送點開啟，到布陣地方後，便開始布陣將天之痕封印，古月仙人要主角有所心理準備，因為玉兒的記憶從此消失。正當儀式要開始時，郡主闖入，將郡主打敗後繼續封印的工作，但是封印到壹半發現有人在破壞赤貫星中樞，查看後發現竟然是師父在破壞，在吃下撒旦魔果後，師父整個人便的非常瘋狂，主角不得已只得和師父決戰。戰勝後，宇文拓和古月仙人也將天之痕修補封印完畢，主角回去說明事情後，古月仙人將壹行人帶回去。通天塔毀了，神州在唐太宗李世民在魏徵、房玄齡和和李靖等人的輔佐下，締造了壹個前所未有的太平盛世。然而，陳靖仇呢？如同古月仙人所說，拓拔玉兒的記憶在他腦中永遠永遠地消失了，小雪就陪伴在靖仇身邊，玉兒也已投胎轉世。
參考資料
軒轅劍3外傳天之痕 遊戲流程全攻略.西西軟件園[引用時間2017-12-31]