1、畫質不同。《忍者殺手》se版色彩絢麗，畫質逼真，沒有雜質，《忍者殺手》原版色彩暗沈，沒有兩點，兩者畫質不同。
2、流暢度不同。《忍者殺手》se版操作很快，畫面不卡頓，招式流暢，《忍者殺手》原版在操作過快時會出現卡頓現象，兩者流暢度不同。