過場影片：
實驗室裏，兩個人躺在椅子上，胸前是壹個玻璃罩。異形的幼蟲從兩人的胸前破出。“那是最後壹個了，開始樣本回收”兩個研究人員推著小車進入實驗室。“6號樣本怎麽回事？”異形幼蟲從椅子上躺著的人嘴裏出來了。“後退、後退！”兩人向控制室裏求救。裏面的人按下了應急按鈕。“不，我想讓它活著，我喜歡這家夥。”Weyland把實驗員的手從按鈕上拿開。“給它做上標記”機器在它額頭上打上6號的標誌，這就是玩家的第三次重生了，做了人，做了鐵血，這次做異形6號。
第壹關ReseaarchLab
根據前面人的手指來移動鼠標，鼠標跟著他的手指尖就行了。然後枷鎖打開，可自由移動了。可以按住MOUSE3到達任何壹面墻上，註意鼠標指針的變化就能知道哪是地面了。在墻上的話再按MOUSE3可以回到地面，按空格能跳到任意的地方。會了這些以後，士兵押進來壹個人練習用左鍵攻擊，打死後按右鍵用尾巴打掉所有的燈。再進來壹個，按住SHIFT加左鍵遠距離攻擊，近距離時右鍵蓄力攻擊。按R發出叫聲，引誘敵人，這次來個拿手槍的，幹掉他。下面任務是逃出去，註意異形的指示點是圓形的。出來跳上通風道，向前走任務完成。
怎麽又被捉住了，不知哪爆炸了。掙脫鐐銬，跳上通風道。在裏面可試試按Q快速沖刺，哈哈，絕對超過70碼，不過最好小心點別撞死人啊！從通風道裏跳下，按E咬壞控制電腦，哈哈，異形兄弟姐妹們都逃出來了。前面是壹步哨槍，可從屋頂上過去。根據指示點跳進另壹通風道裏。到達另壹控制室，咬壞電腦，解救女王。哈哈，兄弟姐妹都出來了。咬掉另壹電腦，開門大家逃脫。
第二關Colony
主角從洞裏鉆了出來，先擺了個POSE，頭上刻著數字6。
鉆進通風道，跳進下水道，擊毀電閘。沿下水道走，在壹個亮燈的地方跳進上方通風道裏。向前走，下面有兩個拿火焰噴射器的士兵，跳下去幹掉。下水道的出口處有數名士兵把守，在稍微退後壹點的上方有通風道的入口，跳上去，就能出去了。從屋頂到達正對的通風口。檢查點那好多人啊，跳下去，擊碎那電閘。看到壹旋轉的發電機樣的東東，檢查點在發電機上方。
在通風道裏找路前行，跳下去。按E打開壹扇門，前面那家夥看到主角來了，竟然用槍自殺了。在堆滿雜物的通道，從墻上過去，找路上樓。暈，樓梯正對著壹架步哨槍。任務是殺掉或收割所有的人，完成任務後進入指示點過關。
第三關Refinery
壹進來是在屋頂上。根據指示，按E打開門，再跳上通風道。進入發電機房，到另壹側再按E打開門，再根據指示點進入控制室。這裏有個家夥實在想不開，拿手槍自殺呢！
通風道在幾個紙箱後面，哈，裏面好大的風啊，壹哥們被風吹到墻上給粉碎了。可指示點在下面，怎麽過去呢？只能往前硬沖了，按著加速才能對抗這大風。
到了下面，有兩個步哨在那裏等著呢，小心。向那兩個步哨相反的方向走，前面又是壹步哨和壹男壹女兩個士兵，從屋頂或另壹條路轉過去就能看到指示點了。指示點是壹電閘，把它打掉，哈援軍出現了。然後出大門就過關了。
第四關Jungle
開始在樹上，任務是切斷鐵絲網的電源。入口是大門右邊的通風道，進入院子小心兩個步哨槍，到指示點處切斷電源。這圖有趣:非禮啊，不要啊，yamede~~~
跳進通風道再跳出來，又到了那熱帶雨林了。下面任務是破壞天線，爬到天線架子上破壞它。註意先把附近的敵人清除幹凈。破壞了天線再清除下面的所有敵人。
下面還是到那邊有霧的山谷那邊，通過那大門。暈，都走兩遍了。還是那院子，可沒有士兵把守，只有在屋子B03裏有個人，指示點顯示在他附近。這次的入口是在地面上那破損的下水道。然後進入另壹間屋子B04,誰知這是陷阱，把屋子裏的燈全部打滅，敵人開門會進來。消滅所有陸戰隊員。破壞兩個發電機的開關。下面的任務是進入B02。唉，累傻小子呢，這幾間房子都轉來轉去的，要買房啊？爬墻上去，進入B02的二層,下來到壹樓開門。在壹層的下水道進入另壹房子B01,上二樓咬壞電腦打開大門。屋子裏操作電腦的這位性子更烈，竟然直接把自己經引爆了，這夥計中東來的吧？出來到達大門處過關。
第五關Ruins
又是神廟，骷髏士兵把守，小心他們死了後那爆炸。院子中間亭子的平臺上有個通風道入口，下來後掉到壹個壓力觸發的開關上，還有壹個找到並觸發。看來遊戲對三個種族分別設計了不同的開門方法。如圖這個位置有個壓力觸發開關，可打開發藍光處的柵欄。
進入房子，破壞發電機。下個院子的門打開了，裏面有個鐵血戰士，暈，開來個飛船，下來第二個鐵血。完嘍，壹下打兩鐵血戰士？還好不時有異形兄弟來幫忙，好不容易把這兩個收拾了。
又從上面跳下來壹位，這位是BOSS級的了。使出6號我的平生所學，跟妳大戰三百回合。把它的所有生命值打掉，它也把主角打倒在地，用尾巴發出最後壹擊幹掉了它，摘下它的面具，把幼蟲給它種上。
遠處建築裏，異形的女王被大火吞滅。6號也體力不支無力的倒在了地上。
陸戰隊員走了過來，把槍口對準了6號“不，不要殺它。這是個老朋友了”說話這老朋友當然是Weyland了，把6號帶上了飛船回到基地
基地裏屍橫遍野，地穴深處已經變成異形的巢穴了，Weyland也被固定在了蠶繭上，另壹邊是6號。
突然6號頭部裂開，完成了變異，壹個新的女王脫穎而出