U.C.0079年，壹年戰爭開戰11個月，獲得奧德賽作戰大勝的聯邦政府軍，開始編成機動戰士部隊，並收集實戰資料。鑒於WITE BASE中阿姆羅的輝煌戰績，聯邦政府計劃將高達量產化，並配備NEW TYPE駕駛員
聯邦軍西羅少尉在降落地球的途中與吉恩軍女駕駛員艾娜·薩哈林相遇，兩人之間產生了愛的火花。然而戰場上是殘酷的，天田士郎被懷疑為間諜並因此而被送到最前線，艾娜則受自己哥哥的擺布替其測試新型機動裝甲。壹對情人雖幾度相遇，卻總是各自為敵……
此乃為了紀念高達20周年所制作的電影，將OVA的1～7集匯編壹下，並增添壹位情報部米拉情報官，她是前來調查西羅間諜罪行，由她的行為將這幾集OVA的內容精簡、穿插在壹起。
U.C.0079年，壹年戰爭末期，聯邦軍對應阿姆羅·雷的能力，秘密地在中立衛星SIDE 6開發新型高達。持有對MS好奇心理的少年阿爾弗雷德拍下了新高達ALEX的有關資料，引來了吉恩軍的特種部隊“獨眼巨人CYCLOPS”，還與其新成員巴尼結下了深厚的友情。巴尼的任務是要摧毀ALEX，否則吉恩軍將不惜用核彈摧毀中立衛星SIDE 6。在阿爾弗雷德的幫助下，巴尼與ALEX展開生死對決。但他卻不知道，此時吉恩軍已經宣布戰敗，而他的對手高達ALEX的駕駛員是他的戀人克莉絲汀娜·瑪肯吉。
U.C.0083年，以埃基尤·狄拉茲大佐為中心的吉恩軍殘黨，再度成立吉恩軍，並實施令衛星墜落地球的“星辰作戰”。聯邦軍的駕駛員浦木宏和他的母艦為阻止吉恩軍，竭盡最大的努力與之周旋。但這場戰爭最終被聯邦軍高層利用的政治鬥爭而已，最後衛星墜落地球，造成二分之壹的地球人死亡。
U.C.0087年，壹年戰爭結束後的第七年，地球聯邦政府的私兵集團提坦斯開始對衛星施行殘酷的制壓。為了抵抗提坦斯，由聯邦軍費尼斯·霍拉準將創建的反地球聯邦組織幽谷（A.E.U.G），在化名為柯瓦特羅·巴基納的夏亞·阿茲納布爾帶領下，堅持不懈地與其作鬥爭。少年卡繆·比丹從提坦斯中叛逃，在幽谷的幫助下，成為宇宙巡航艦阿伽馬的成員。在提坦斯與哈曼領導的新吉恩軍之間相互勾心鬥角的戰亂中，卡繆接二連三地失去了自己所愛的人，最後承受不住膨大化的NEWTYPE能力，精神開始崩潰。
U.C.0088年，衛星SIDE 1的廢品屋，擁有操縱MS才能的少年捷多·亞西塔搭乘上巡洋艦阿伽馬。不能理解大人們思想的捷多，駕駛ZZ 高達，在幽谷和阿克西斯的戰鬥中逐漸成長。
U.C.0088年，掌握了聯邦軍內主導權的奧古繼續和自稱“ND”提坦斯的殘黨交戰。幽谷以“天馬Ⅲ”旗艦為首，專門編成了討伐ND的部隊。搭載著試驗機S GUNDAM和Z GUNDAM的量產型Z plus，討伐隊飛向ND占領的宇宙空域。
U.C.0093年，新吉恩軍的總帥夏亞·阿茲納布爾，再度挑起與地球聯邦政府之間的戰爭。陷入窘地的聯邦軍，讓隸屬幽谷的阿姆羅·雷和布拉度·諾亞組建獨立部隊隆德·貝爾艦隊。高呼“將人類從地球的束縛中解放出來”的夏亞，欲將小行星阿克西斯墜落地球。阿姆羅駕駛新高達，與其宿敵夏亞做最後的生死鬥。
U.C.0103年，布萊度·諾亞艦長的兒子哈薩維經歷了夏亞·阿茲納布爾的反亂（逆襲的夏亞），在失去所愛的人之後，了解到地球聯邦政府的腐敗，開始組建秘密社團馬法狄·納比尤·艾林，展開暗殺聯邦要員的恐怖活動。
U.C.0120年，木星級的輸送艦コバヤシ丸被神秘的MS部隊襲擊，測試中的GUNDAM F90試作2號機被奪。神秘MS部隊的真正身份是駐守火星的吉恩軍殘黨，聯邦的駕駛員乘坐1號機追蹤而去。
U.C.0123年，自稱CV（死亡先鋒）的謎之MS部隊先後襲擊了安羅狄亞地區的衛星，並將之占領發布宣戰通告。剛從軍校畢業的西布克·阿諾駕駛新開發的GUNDAM F91，奮戰在地球聯邦軍與CV交鋒的最前線。
COMIC《十字骷髏高達X》 出身地球圈的少年托比亞·阿羅納克斯與他的同伴們，作為地球--木 星文化交流與促進而派遣的留學生來到了木星。身為出生在地球圈的他們，有生以來第壹次來到木星圈而倍感興奮。 在留學生們所乘的運輸船航行期間，突然受到巨大海盜旗艦帶領下的神秘MS部隊的襲擊。其中有兩部類似於高達的背部裝有X型的推進器的MS壹黑壹白異常的強悍。 眼看護航的MS節節敗退，身為機械工學系學生的托比亞·阿羅納克斯開啟壹架護航MS強行出擊，但瞬間被X1擊毀。但托比亞發現海盜們並不殺害那些機師包括把他打下的X1。
U.C.0153年，衛星SIDE 2的桑斯卡爾帝國開始對地球發動侵略。13歲的少年伍索·艾文，偶然搭乘上抵抗組織“利加·米利狄亞”的VICTORY GUNDAM，和青梅竹馬的玩伴夏克蒂壹同卷入戰爭中。
A.W.（AFTER WAR）0015年，第七次宇宙戰爭的“衛星墜落”，令地球人類遭受到毀滅性的打擊。15歲的孤兒卡洛德·蘭，擁有不俗的MS駕駛能力。而後，為了守護背負著被戰爭而利用的NEWTYPE宿命的少女蒂法·雅蒂爾，卡洛德駕駛著GUNDAM X和宇宙革命軍壹起與新聯邦政府軍展開激戰。
A.C.（後殖民衛星）195年，地球聯邦政府內羅姆費勒財團的精英兵部隊OZ正急速擴大其勢力。為了與之相對抗，衛星的地下秘密組織分別派遣五部高達偽裝成流星，降落地球並破壞OZ。然而“流星行動”反被OZ加以利用，迅速地取代了地球聯邦政府，並用懷柔政策拉攏了衛星。五位駕駛高達的少年被他們的故鄉衛星所出賣，開始了孤獨的戰鬥之旅。
A.C.195年，邊境的工業衛星MO-V獨自開發機動戰士。因為開發的機體酷似與OZ敵對的高達，OZ的秘密部隊普萊斯向MO-V展開了掃蕩。
A.C.196年，大戰後的地球圈迎來壹片和平，五位少年也將他們的高達送往太陽銷毀。就在此時，原OZ首領托列斯的女兒瑪麗美婭在其外公的操縱下向地球圈統壹國家宣戰，並開始實施真正的“流星行動”。
F.C.（未來世紀）59年，各個衛星之間的主導權由每四年壹屆的GUNDAM FIGHTER大會的優勝者來決定。Neo JAPAN的代表火洲土門出戰GUNDAM FIGHTER大會的真正目的，是為了打倒被魔鬼高達所控制的哥哥、以及幕後策劃者-自己的師父東方不敗。
宇宙歷的2000年後，地球人忘卻了曾經高度發達的科學技術，忘記了過去曾在宇宙中的生活以及那血腥的戰爭歷史，地球又回歸到產業革命的時代。15歲少年羅蘭·西雅克乃月之民的末裔，從月球來到地球考察這裏的居住環境。當他習慣了地球安穩的生活，以為可以讓月之民回到地球、大家和平***處時棗2345年，夏至日。月之民對地球展開歸還作戰，其先鋒乃40米高的巨大兩足步行兵器“機動戰士”。地球方面卻只能以高射炮臺、雙葉飛機這些落後的裝備與之對抗。此時，羅蘭發現了埋藏於地上的宇宙時代的遺物-機動戰士高達TURN A！駕駛著TURN A的羅蘭，輾戰地球與月球之間，摸索著回避戰爭的方法……
《機動戰士高達》的歷史從U.C.0079的壹年戰爭開始，經歷了數百年、四個世紀（U.C.宇宙世紀、A.W.後戰爭世紀、A.C.後殖民世紀、F.C.未來世紀），其間爆發過無數次戰爭，死亡者不計其數。與其它機器人作品不同，高達是壹部反映戰爭的作品，通過血腥、殘酷的戰爭來告誡人們和平的可貴及生命的意義。在高達世界裏，人類忍受著嚴酷的環境，在宇宙中不斷開發新的技術、新的資源，甚至將宇宙當成第二故鄉長期居住下去。應該說這是人類必然的發展，但是矛盾亦隨之產生。地球，人類的起源之地，留在那裏的人都是統治階級，安享著繁榮與安定生活的地球聯邦政府繼續對宇宙中的人們實行殖民統治。再嚴酷的環境都能忍受，但是被他人壓迫、剝削卻是必須奮起反抗的。宇宙歷0058年，SIDE3的吉恩·斯姆·戴肯宣布殖民衛星的獨立，他的理念是要替宇宙的居民們爭取平等與自由。然而，原本和平的理念最終還是被他人給利用了。吉恩·斯姆·戴肯被暗殺、取代他的狄金·索德·紮比建立起基奧公國，利用衛星的居民向地球聯邦軍發動戰爭，滿足他自己的野心。欲望所挑起的戰爭，隨著地球和宇宙這兩個對立面的尖銳化而永不停止，每個人都認為自己是正義的，“和平”與“正義”這兩個名詞在戰爭中被使用的次數最多，也是最被歪曲的字眼。“正義”究竟是什麽？“和平”又要怎樣來實現？現在就讓我們來揭開高達歷史的第壹頁，瀏覽壹下地球和宇宙的第壹次交鋒，請妳自己來找尋答案。 公元1999年 面臨人口、資源、環境各方面危機的人類社會終於為攜手開創新時代而實現統壹，成立地球聯邦政府，並發表人類宇宙移民計劃。之後為了保證地球圈的安定與和平，2009年，地球聯邦軍正式建立。 2045年 第1號太空殖民衛星開始動工建造，之後陸續又建起許多殖民衛星，並根據宙域將其劃分為SIDE1至SIDE7七個區域。當人類開始向最初的衛星移民時，人類歷史便進入了宇宙世紀，紀元亦改為宇宙世紀（簡稱U.C.）0001年，此時地球總人口數突破90億。
重組戰爭之後，有壹部分科學家通過基因技術制造出了壹種各方面能力都超過壹般人類的強化人，被稱作調整者。後來，由於證據1的出現，宗教界的威信崩潰，人們漸漸接受了調整者這壹特殊的存在。 由於各方面調整者和自然人的沖突，在長期的計劃後，由調整者衛星組成的“Z.A.F.T”（紮夫特）和投資建設衛星的理事國的對立日漸明顯，終於，在受到ZAFT持續的小規模襲擊後。C.E70年2月14日，地球軍向P.L.A.N.T農業衛星狄尼尤斯7發射核彈，摧毀了它，人稱“血色情人節”（阿斯蘭的母親雷諾亞.薩拉也在此事件中喪生，阿斯蘭也因此加入軍隊）。之後雙方放棄了所有的外交努力，撕破臉皮開始軍事行動，慘烈的宇宙戰爭由此爆發…
C.E.70年2月，地球聯合軍與ZAFT之間的武裝沖突由於“染血的情人節”悲劇而全面升級為地球圈規模的戰爭。C.E.71年6月，在“非我即敵”的觀念驅使下，地球聯合軍悍然發動了對中立國家奧布聯合酋長國的侵略。當戰鬥進行到最激烈的時候，就在自己的眼前，少年飛鳥真失去了父母和妹妹。唯壹的遺物，就只有妹妹掉落的手機……獲救之後，背負著家仇的真黯然離開了故土奧布前往PLANT。兩年後，他成為了ZAFT的戰士…
由於化石燃料的枯竭，人類開始尋找全新形式的能源——由3條巨大的軌道式升降梯所組成的巨型太陽能發電系統。然而，能夠分享這壹能源的，只有世界上的壹部分大國及其同盟國。 擁有3條巨大的軌道式升降梯的3個超大國及其聯盟：以「美利堅合眾國」為中央政府領導的的「UNION（世界經濟聯合）」，以「中國」、「俄羅斯」、「印度」為中心的「人類革新聯盟」，以及以歐洲為中心的「AEU（新歐盟***同體）」。各大國家聯盟為了各自的威信和繁榮，開展了龐大的爭霸遊戲。沒錯，即使歷史的滾輪駛入了24世紀，人類依然保持著四分五裂的狀態。 在這個戰爭終日不絕的世界，壹個宣稱“以武力根絕戰爭”的私人武裝組織出現了。擁有機動戰士「高達」的他們，名為「天人武裝組織（Celestial Being）」。憑借高達強大的性能，他們開始對各國紛爭進行武力介入。 公元2312年 面臨人口、資源、環境各方面危機的人類社會終於為攜手開創新時代而實現統壹，成立地球聯邦政府，並發表人類宇宙移民計劃。之後為了保證地球圈的安定與和平，2312年，地球聯邦軍正式建立。
劇情設定在西元2312年，即聯合國軍與「天人武裝組織」大戰後四年，世界各大聯盟和各國放棄了各自的軍隊，將軍隊合體為「地球聯邦（Earth Sphere Federation）」，形成軍事統壹形式。但政治上依然保持著各自的獨立，同時「天人武裝組織」也在暗中開發新高達。
UC 劇情 ：在第二次新吉恩戰爭、別名“夏亞的叛亂”終結後，地球圈取得了短暫的和平。這之後3年，宇宙世紀0096年。在工業殖民地“工業7號”上進行了壹項秘密交涉。內容為－－被認為是地球聯邦政府暗中操控的“比斯特財團”將把最高機密“拉普拉斯之箱”交給新吉恩的殘黨軍“袖付”。 另壹方面，在安納海姆工業專門學校就讀的少年巴納吉·林克斯遇見了自稱為奧黛麗·本的少女（實為舊吉恩公國次男多茲魯·紮比之女，米涅芭·紮比） 奧黛麗為了制止新的戰爭爆發，必須阻止“拉普拉斯之箱”的交易。巴納吉在數次幫助奧黛麗之後，逐漸被她所吸引。 隨後，地球聯邦察覺了這起交易，並進行軍事介入，工業殖民地隨即化為壹片火海。巴納吉和同伴壹邊避難壹邊尋找著奧黛麗，而出現在他面前的是比斯特財團的當家卡迪阿斯·比斯特。奄奄壹息的卡迪阿斯將出生的秘密告訴了巴納吉，並且將箱之鑰匙－－“機動戰士高達獨角獸”托付給他。 隨後，壹場圍繞“拉普拉斯之箱”的戰爭開始了。