結局：沙陀（梁家輝）壹心想毀滅武則天，不讓女王登基 在修建的“通天浮屠”上做了手腳，想在女王登基之日，弄毀佛像。
塌向皇殿 不料被賈大人（工部侍郎）發現了平安符後面的建築構造，於是沙陀就利用赤炎金龜的特性 殺死了賈大人。
還散布謠言是天譴，免得有人去動通天柱上的平安符，期間沙陀找人假扮國師，引誘狄仁傑眾人懷疑國師所在的無極觀。
隨著狄仁傑調查的深入，沙陀不得不除掉發現設計圖秘密的裴東來（大理寺少卿），沙陀想借李大人（瑯琊王李宵）之手，殺掉狄仁傑。
可惜李大人想勸狄仁傑臣服於自己，所以後來也招殺身之禍，裴東來犧牲後給了狄仁傑暗示 狄仁傑找到了設計圖紙，知道了通天浮屠的秘密。
也知道了沙陀是幕後的主使，決定找他昔日的老朋友，解開最後的謎底。
兇手：是沙陀，作案工具是能使人自燃的壹種蟲子,赤炎金龜。
擴展資料沙陀
整個事件的幕後黑手，敏銳中透著神秘，沈穩裏醞釀計謀，他是繁華看盡後的返璞歸真，是大風大浪裏的不屈不倒。
老謀深算是他人格中最終極的堅持，三思而後行，算定而後作，不會輕狂也不會輕信，他和裴東來仿佛男人的兩極，壹個是火焰，壹個是冰山。
電影評價：
影片以廟堂內鬥以替代江湖書寫，可以用“奇、險、急、滿”四個字來形容，作為徐克壹貫的風格，本片尤其突出。
開篇的自焚案足夠奇。接下來通天浮屠、地下城和國師道場都遠遠超越絕大多數電影人的想象。狄仁傑、武則天和上官靜兒/國師、裴東來的處境無壹不險象環生，只有沙陀集團安步當車。
參考資料：
百度百科-通天帝國