上帝要求諾亞用歌斐木建造方舟，並把舟的規格和造法傳授給諾亞。此後，諾亞壹邊趕造方舟，壹邊勸告世人悔改其行為。諾亞在獨立無援的情況下，花了整整120年時間終於造成了壹只龐大的方舟，並聽從上帝的話，把全家八口搬了進去，各種飛禽走獸也壹對對趕來，有條不紊地進入方舟。7天後，洪水自天而降，壹連下了40個晝夜，人群和動植物全部陷入沒頂之災。除諾亞壹家人以外，亞當和夏娃的其他後代都被洪水吞沒了，連世界上最高的山峰都低於水面7米。
上帝顧念諾亞和方舟中的飛禽走獸，便下令止雨興風，風吹著水，水勢漸漸消退。諾亞方舟停靠在亞拉臘山邊。又過了幾十天，諾亞打開方舟的窗戶，放出壹只烏鴉去探聽消息，但烏鴉壹去不回。諾亞又把壹只鴿子放出去，要它去看看地上的水退了沒有。由於遍地是水，鴿子找不到落腳之處，又飛回方舟。七天之後，諾亞又把鴿子放出去，黃昏時分，鴿子飛回來了，嘴裏銜著橄欖葉，很明顯是從樹上啄下來的。諾亞由此判斷，地上的水已經消退。後世的人們就用鴿子和橄 欖枝來象征和平。
這就是"諾亞方舟"故事的由來，雖然是個傳說，但由於《聖經》中記載的很多事情都被證實是真實的，譬如，在壹次戰爭中，壹位軍官根據《聖經》中的記載，成功地找到了大山裏的壹條秘密小道，並通過這條小道突然出現在敵人面前，取得巨大勝利。如果能證明"諾亞方舟"也是真實的，那麽這個發現肯定將在全世界引起轟動。所以，很多年以來，許多國家的聖經考古學家 都希望揭開這個千古之謎。