指《名偵探柯南》TV版動畫中偶爾播出的長度超過壹般劇集（30分鐘）的電視特輯，簡稱SP，壹般所稱的“特別篇”均指代此類。計入電視動畫正式劇集。（動畫列表中以“★”進行標示）
《魔術快鬥》相關特輯
屬於《名偵探柯南》的特別篇動畫，以第二代怪盜基德（黑羽快鬥）為主要人物，改編自青山剛昌的另壹部漫畫作品《魔術快鬥》。雖在柯南播放時段播出，但官方未將其計入柯南動畫正式劇集。後其相應內容以《魔術快鬥》正式動畫的形式獨立發行，並收錄於DVD與BD中。
其中《怪盜基德誕生的秘密》是“M 14公開紀念特別篇”，屬於劇場版特典，改編自2010年4月17日於ANIMAX頻道獨立播放的《魔術快鬥》動畫第1集《復活的怪盜》。其他集數均未以《魔術快鬥》動畫形式獨立播出。
序號
名稱
播出時間
對應《魔術快鬥》漫畫
1
名偵探柯南 M 14公開紀念特別篇 怪盜基德誕生的秘密
2010年4月24日
Vol.1 File.1
2
名偵探柯南 怪盜基德夏日祭 怪盜基德忙碌的約會
2011年8月6日
Vol.1 File.4
3
名偵探柯南 怪盜基德夏日祭 公主殿下愛魔術
2011年8月13日
Vol.1 File.2
4
名偵探柯南 怪盜基德特別篇 魔女不流眼淚
2011年9月24日
Vol.1 File.6 & Vol.2 File.4
5
名偵探柯南 怪盜基德特別篇 命運的藍色生日
2011年10月29日
Vol.3 File.5
6
名偵探柯南 怪盜基德特別篇 戀愛滑雪場的聖誕夜
2011年12月24日
Vol.2 File.1
7
名偵探柯南 怪盜基德夏日祭 魔術快鬥 華麗的對手們
2012年8月4日
Vol.3 File.2-3（有原創劇情）
8
名偵探柯南 怪盜基德夏日祭 紅色之淚的秘密
2012年8月11日
Vol.4 File.2
9
名偵探柯南 怪盜基德特別篇 魔女與偵探與怪盜
2012年9月29日
Vol.3 File.4（有原創劇情）
10
魔術快鬥 追憶的黃金之眼
2012年11月3日
Vol.4 File.5-6
11
魔術快鬥 淚之水晶之母
2012年12月22日
Vol.4 File.1
12
魔術快鬥 暗夜騎士愛的眼淚
2012年12月29日
Vol.4 File.7-8
旅遊特別篇
自2001年以來，小學館開始進行“旅遊篇”特別策劃。大多為每年制作壹次，均為動畫原創故事，描寫主人公到日本壹些著名的景點時遇到事件，也介紹了當地的名勝和文化特色。為了配合現實中由JR西日本、JR九州等鐵路公司策劃的神秘之旅活動而制作。[11]
集數
名稱
播出時間
主要景點
236~237
南紀白濱的神秘之旅
2001年6月
白濱溫泉、三段壁、白良濱（和歌山縣）
255~256
松江玉造連句大戰十四回合
2001年10~11月
松江城（島根縣松江市）
299~300
關門海峽的友情與殺機
2002年11月
關門海峽（山口縣 福岡縣 本州與九州交界處）
342
豪斯登堡的新娘
2003年11月
豪斯登堡（長崎縣佐世保市大灣村）
377~378
桃太郎解謎之旅
2004年11月
倉敷市（岡山縣）
419~420
八岐大蛇的劍
2005年11月
出雲市（島根縣）
518~519
明治維新神秘之旅
2008年12月
美彌郡秋吉臺國家公園 - 秋芳洞（山口縣）
554~555
鸛的探索之旅
2009年11月
城崎溫泉（兵庫縣）
594~595
廣島宮島的七大不可思議之旅
2010年11月
廣島、宮島（廣島縣）
640~641
8枚速寫記憶之旅
2011年12月
倉敷市（岡山縣）
678~679
長崎謎之劇場
2012年12月
長崎市（長崎縣）
720~721 火與水的神秘之旅 2013年11~12月 阿蘇市（熊本縣）
761~762 加賀百萬石神秘之旅 2014年12月 金澤市、加賀市（石川縣）
801~802 鳥取沙丘神秘之旅 2015年11~12月 倉吉市（鳥取縣）