壹九九七年，由淳君 ( つんく ) 領軍的搖滾樂團「榭亂Q」 ( シャ亂Q ) 與電視節目「ASAYAN」合作，舉辦了女性搖滾歌手試演會「シャ亂Qロックボーカリストオーディション」。經過五個月的選拔，最後由來自大阪的十八歲女高校生平家充代獲勝。雖然試演會落幕了，但是故事才正要開始。淳君於會後召募了決賽中五位落選的女孩，再給她們壹次機會。只要她們在五日之內，達成銷售五萬張單曲的紀錄，就能夠重拾成為藝人的希望。於是，這五位女孩組成了女子團體「早安少女組」 ( モーニング娘。 ) ，並且錄制限量五萬張的單曲「愛の種」，進行全國五大城市的試賣會。在極艱鉅困難的環境下，她們終於完成了銷售五萬張單曲的任務，正式出道。這五位女孩，就是早安少女組的初代成員：中澤裕子、石黑彩、飯田圭織、安倍なつみ和福田明日香。
壹九九八年五月，早安少女組第壹次增員，增加了保田圭、矢口真裏和市井紗耶香三人。同年九月，早安少女組推出的第三張單曲「抱いてHOLD ON ME!」大受歡迎，成為早安少女組的首張冠軍單曲。當成績揭曉的那壹刻，成員們於攝影棚相擁而泣。
在音樂總監，也是唱片制作人淳君的努力經營下，早安少女組逐漸展露出多樣的風格，不再只是給人「親切的鄰家女孩」的印象。同年六月，隊長中澤裕子挑戰演歌路線，推出個人單曲「カラスの女房」。同年十月，成員石黑彩、飯田圭織和矢口真裏，另組「蒲公英」 ( タンポポ ) 。這是早安少女組的第壹個分支團體，以成熟性感的音樂路線攻占唱片市場。
壹九九九年四月，年紀最小、但最具歌唱實力的成員福田明日香宣布卒業 ( 退團 ) ，再加上連續二張單曲的銷售成績不盡理想，淳君為了激勵現有的七位成員，宣布第二次增員計畫。三個月後，由年僅十三歲的後藤真希通過試演會以及合宿的考驗，從壹萬壹千餘人中脫穎而出。淳君原定在這壹次增員計畫中增員二人，但是最後只有後藤真希壹人取得資格，出盡鋒頭，再加上後藤真希其搶眼的外型、迷糊卻不失可愛的個性，「後藤效應」逐漸發酵。在後藤真希加入不到壹個月後，早安少女組便推出了第七張單曲「LOVEマシーン」。曲風熱鬧、俏皮，加上貼切生活面的歌詞，發行首周即奪下排行榜冠軍，隨後狂賣，成為早安少女組第壹張銷售量突破百萬的單曲，也是當年 KTV 點播率最高的歌曲。早安少女組壹躍成為日本全國最受歡迎的「國民偶像」，開始引領話題、帶動流行.
同年十壹月，成員保田圭、市井紗耶香和後藤真希另組「小早安」 ( プッチモニ ) 。這是早安少女組第二個分支團體，青春、活潑，受歡迎的程度不亞於母體「早安少女組」，首張單曲「ちょこっとLOVE」的銷售量更突破百萬，初試啼聲就能夠有此佳績，實屬不易。不過在此同時，初代成員之壹的石黑彩突然以專心學業為由宣布卒業，令歌迷感到壹陣錯愕。
二○○○年壹月，早安少女組推出第八張單曲「戀のダンスサイト」。繼承了「LOVEマシーン」式的熱鬧曲風，再壹次為早安少女組增加壹張銷售百萬級的單曲。連續締造了三次銷售突破百萬的紀錄，早安少女組於日本流行樂壇的地位更為穩固。
在早安少女組大活躍之際，淳君並不以此自滿，而是趁勝追擊，培育更多新人。除了原有的早安少女組、平家充代，旗下還有太陽與月亮 ( 太陽とシスコンムー ) 、椰果少女組 ( ココナッツ娘。 ) 、哈密瓜記念日 ( メロン記念日 ) 等團體。家喻戶曉的「早安家族」 ( ハロー！プロジェクト ) 雛形就是這麼建立起來的。同年三月，淳君將早安家族所有成員全部打散，分為「黃、青、紅」三組，三組錄制的單曲於同壹天發行，旋風似的包辦排行榜二至四名，成為話題。類似這樣「早安家族大洗牌」的特別企畫，每年都會上演壹次，壹方面帶給歌迷新鮮感，另壹方面也藉機拉拔早安家族中後輩新人的知名度。淳君成功的經營策略，讓「早安家族」儼然成為少女偶像的培育學園，足以和旗下擁有數十位少男偶像的「傑尼斯家族」 ( ジャニーズ ) 分庭抗禮.
同年五月，早安少女組再壹次的增加成員；這次壹口氣增加了四人，石川梨華、吉澤ひとみ、辻希美和加護亜依成為早安少女組的第四代新生成員。不過第壹次增員時加入的市井紗耶香在此時宣布卒業，早安少女組的人數減為十人。
這壹年的早安少女組，開始嘗試音樂以外多元化的發展。除了原有的發行唱片和寫真集，也開始嘗試主持電視、廣播節目，擔任商品廣告和公益活動的代言人。由早安少女組主演的電影「危機跑者」 ( ピンチランナー ) 於五月上映，以早安少女組為主角的電玩遊戲軟體「太空維納斯」 ( スペースヴィーナス ) 也在年底上市。同年九月，早安少女組的第十張單曲「I WISH」成為二○○○年雪梨奧運日本代言主題曲。早安少女組除了為實況轉播節目宣傳，更親赴雪梨，為日本國家代表隊加油。
二○○壹年壹月，成員矢口真裏、辻希美、加護亜依，以及「椰果少女組」的ミカ組成了早安少女組第三個分支團體「迷妳早安」 ( ミニモニ。 )並且推出首張單曲「ミニモニ。ジャンケンぴょん！」。這壹首「小孩子的流行歌曲」狂賣近百萬張，讓迷妳早安成為日本兒童最喜愛的偶像團體。迷妳早安的成功，讓淳君開始思考攻占青少年以外市場的重要性，也決定了未來早安少女組和早安家族「成員年輕化」的最高指導原則.
同年三月，與早安少女組壹起走過近四個年頭的二十七歲隊長中澤裕子，宣布將於五月卒業。裕子的卒業，讓早安少女組的人數減為九人，也宣告了早安少女組另壹個時代的來臨。另壹方面，成員中人氣指數極高的後藤真希，也繼中澤裕子之後推出了個人單曲，首張單曲銷售成績表現不俗，進而讓後藤真希勇於嘗試更多的個人演藝活動。像是參與了連續劇「醫家姐妹」 ( マリア ) 的演出，飾演壹名罹患白血病的孤僻少女，精湛的演技不輸先前也參與連續劇演出的另外壹位成員安倍なつみ。
同年七月，早安少女組推出了第十二張單曲「ザ☆ピ～ス！」。有別以往以安倍なつみ和後藤真希「雙主唱」的作法，淳君這壹次將主唱的棒子交給石川梨華，並安排她站在九位成員的正中央，「石川梨華儼然成為早安少女組新壹代主角」的論點立刻彌漫各大媒體影劇版頭條。同年八月，報名人數超過二萬人的試演會「LOVEオーディション21」再壹次為早安少女組增加了四位成員：高橋愛、紺野あさ美、小川麻琴和新垣裏沙。同年十月，早安少女組的第十三張單曲「Mr.Moonlight～愛のビッグバンド～」推出。這壹次由吉澤ひとみ擔任主唱，連同安倍なつみ和後藤真希反串英俊小生，令人耳目壹新。
二○○二年的早安少女組和早安家族，充滿了詭譎多變的氣氛。六月，淳君舉辦了十二歲以下的兒童試演會「キッズ?オーディション」，選出了十五位平均年齡不到九歲的小學生，為早安家族註入新血。雖然這十五位小學生的加入並不直接影響早安少女組既有的成員組合，但是各種有關「某某成員即將卒業」和「早安少女組即將大換血」的傳聞開始甚囂塵上。七月三十壹日，壹件被喻為「七三壹大地震」，也是歌迷們最不願意看見的事情發生了。事務所毫無預警的宣布壹項「ハロー！プロジェクト構造大改革」計畫，將以半年的時間，陸續將早安家族旗下所有團體進行大規模的重新編成。其中，自「LOVEマシーン」以來，壹向被視為是早安少女組中堅成員的後藤真希，在事前未獲得告知的情況下，竟被事務所宣布於九月二十三日卒業。另壹位成員保田圭，也被事務所宣布將於明年春季從早安少女組中卒業。第二天，後藤真希於記者會中姍然落淚；這是對離開早安少女組的不舍，也是無奈。