BW01.前往合眾地方!捷克羅姆的身影!!(修帝、艾莉絲、紅豆杉博士登場)
BW02.艾莉絲與牙牙!!(火箭隊原有神奇寶貝寄放在本部,武藏收服滾滾蝙蝠,小智收服豆豆鴿)
BW03.水水獺!黑眼鱷!危在旦夕!!(小智得到水水獺)
BW04.對戰俱樂部!神秘的神奇寶貝現身!!(小智得到暖暖豬)
BW05.三曜道館!VS爆香猴、冷水猴、花椰猴!!(天桐登場)
BW06.夢的遺址!食夢夢和夢夢蝕!!(小智得到挑戰徽章,真菇博士登場,艾莉絲與天桐加入)
BW07.藤藤蛇·迷人收服!?(小智收服藤藤蛇)
BW08.火紅不倒翁與達摩狒狒!鐘塔的秘密!!
BW09.蜈蚣王發飆!救出牙牙!!
BW10.勁敵對戰!強敵輕飄飄!!
BW11.石居蟹!取回自己的家吧!!(天桐得到石居蟹)
BW12.破破袋戰隊與秘密基地!?(小智得到蛋)
BW13.泡沫栗鼠有潔癖!?(白露登場)
BW14.七寶市!博物館大冒險!!
BW15.七寶道館賽!VS道館訓練家·蘆薈!!
BW16.再次挑戰七寶道館!新絕招爆發!!(小智得到基礎徽章)
BW17.從蛋中孵出的小霸王!!(小智的蛋孵化成滑頭小子)
BW18.矢車森林!蟲寶包與亞堤!!(小智收服蟲寶包)
BW19.酒侍對決!石居蟹VS雙刃丸!!(赤霞珠登場)
BW20.皮卡丘VS黑眼鱷VS鴨寶寶!!
BW21.天之箭橋與歌德小姐!!
BW22.飛雲市!百足蜈蚣恐慌!!(豆豆鴿進化成波波鴿)
BW23.飛雲道館賽!純情之心的蟲系神奇寶貝對戰!!(小智得到甲蟲徽章,蟲寶包進化成寶包繭,小次郎得到哭哭面具)
BW24.釣魚酒侍!天桐登場!!
BW25.要小心可愛臉蛋!被導電飛鼠電到發麻!!(艾莉絲得到導電飛鼠)
BW26.導電飛鼠VS藤藤蛇!交換伏特大混亂!!
BW27.燭光靈大宅的恐~怖故事!!
BW28.通往龍系大師之道!牙牙VS赤面龍!!
BW29.消失的扇貝貝!水水獺最大的危機!!(肯尼洋登場)
BW30.戀愛中的木棉球乘風飛翔!!
BW31.小灰怪與不明飛行物體!!
BW32.勁敵對戰!迷妳冰、搬運小匠參戰!!
BW33.藍蟾蜍、泥巴魚!水邊的戰鬥!!(小智收服藍蟾蜍,天桐收服泥巴魚)
BW34.龍之破壞者登場!艾莉絲與龍頭地鼠!!(藍葛雷登場)
BW35.石丸子!發射光澤電炮吧!! (小智收服石丸子)
BW36.酒侍偵探天桐!差不多娃娃失蹤事件!!
BW37.化石復活!古代怪鳥始祖大鳥!!
BW38.索羅亞電影!神奇寶貝騎士傳說!!
BW39.全體集合!東·喬治對戰!!
BW40.激戰東·喬治對戰!藤藤蛇VS駒刀小兵!!
BW41.白熱化的東·喬治對戰!導電飛鼠VS打擊鬼!!
BW42.決戰東·喬治對戰!小智對艾莉絲!!
BW43.交涉喵·喵喵!頭巾混混說服作戰!!
BW44.要小心扒手貓!喵喵與水水獺!!
BW45.大宇怪與雙卵細胞球與夢境小偷!!
BW46.交涉喵·喵喵!突破凍原熊的森林!!
BW47.疾奔!對戰地下鐵!! (前篇)
BW48.疾奔!對戰地下鐵!! (後篇)
BW49.道館訓練家是超級模特兒!小菊兒登場!!
BW50.雷文道館!華麗的電擊對戰!!(小智得到伏特徽章)
BW51.小智、天桐對地下鐵總控官!!
BW52.小智對冠軍·阿戴克!!(阿戴克登場)
BW53.前往彩虹另壹頭!街頭沙鈴的音樂劇!!
BW54.芽吹鹿! 春夏秋冬全部到齊!!
BW55.滑頭小子與任性的哥德寶寶!
BW56.艾莉絲與單首龍!撫養屋修行!!
BW57.敏捷☆戰士對幾何雪男!!
BW58.天桐與伯特,兄弟對決!爆香猴VS花椰猴!!
BW59.龍卷雲VS雷電雲VS土地雲!(前篇)
BW60.龍卷雲VS雷電雲VS土地雲!(後篇)
BW61.地底的道館賽!VS菊老大!(石丸子進化成地幔巖,小智得到顫抖徽章)
BW62.電電蟲、電蜘蛛!電石洞穴!(石居蟹進化成巖殿居蟹)
BW63.通訊交換進化!騎士蝸牛和敏捷蟲!
BW64.黑英雄的遺跡!象征鳥與死神棺!
BW65.二對二對戰!皮卡丘·混混鱷VS蜈蚣王·蟾蜍王!(小智收服混混鱷)
BW66.爆爆頭GO!爆爆頭水牛NO!
BW67.吹寄道館的空想對戰!挑戰者天桐!?
BW68.吹寄道館!VS風露 空中決戰!(波波鴿進化成轟隆雉雞,小智得到噴射徽章)
BW69.突破難關!登上天空之塔!
BW70.東·喬治格鬥大會開幕!滑頭小子對花椰猿!
BW71.不斷繼續吧東·喬治格鬥大會!赤面龍對劈斬司令!
BW72.激戰東·喬治格鬥大會!劈斬司令對炎武王!
BW73.決戰東·喬治格鬥大會!投射鬼對打擊鬼!
BW74.救出牙牙!鐵蟻的巢穴!(寶包繭進化成保母蟲)
BW75.羅斯山的激戰!肋骨海龜的奇跡(前篇)
BW76.羅斯山的激戰!肋骨海龜的奇跡(後篇)
BW77.炎之回憶!暖暖豬VS炎武王!(暖暖豬進化成炒炒豬)
BW78.哈奇庫登場!火神蟲的聖山!
BW79.雪花道館賽!冰之對戰場地!(小智得到冰柱徽章)
BW80.神奇寶貝酒侍對決!品評對戰!
BW81.種子鐵球研究所!艾莉絲與雙倍多多冰!
BW82.電影對決!合眾防衛隊 出擊!
BW83.激戰立湧道館!VS霍米加!(前篇)
BW84.激戰立湧道館!VS霍米加!(後篇)(小智得到毒性徽章)
合眾聯盟(第二季)
BW85.歌唱吧,美洛耶塔愛的旋律!
BW86.波加曼VS花椰猴
華麗的對戰!(小光歸隊)
BW87.大巖蛇島野外求生!
BW88.酒侍偵探天桐!消失的噴嚏熊之謎!
BW89.艾莉絲與小霸王快龍!(艾莉絲收服快龍)
BW90.青少年杯開幕!快龍對凍原熊!
BW91.力量對決!艾莉絲對小光!
BW92.小智、艾莉絲、修帝!最後的對決!(混混鱷進化成流氓鱷)
BW93.道別與相遇的青少年杯!(小光離隊)
BW94.青海波道館賽!巨翅飛魚VS大劍鬼!
BW95.神奇寶貝幼兒園大騷動!毛頭小鷹與禿鷹小子
BW96.美洛耶塔與海底的神殿!
BW97.靈獸型態合力進擊!合眾最大的危機!
BW98.世界上第壹華麗的神奇寶貝!奇諾栗鼠對藤藤蛇!
BW99.天空和大地的雙打對戰!
BW100.艾莉絲,回到龍之鄉!
BW101.雙龍道館,艾莉絲對夏卡!
BW102.伊布隊出動!神奇寶貝救援隊!
BW103.開幕!合眾聯盟·檜垣大會!小智對修帝!
BW104.熱鬥!從勁敵對戰中勝出!
BW105.牙牙迷路走失了!
BW106.打擊鬼登場!小智對肯尼洋!
BW107.小智對虎徹!秘密武器三頭龍!
BW108.決戰合眾聯盟!皮卡丘對路卡利歐!(小智止步檜垣大會前八強)
BW109.紅豆杉研究所!展開新旅行!
BW110.朋友……他的名字是N!
BW111.新道館訓練家!黑連!
BW112.阿克羅瑪VS帥哥!電漿團的陰謀!
BW113.霧之算木牧場!電龍的燈光!
BW114.N再度現身!拯救勇士鷹作戰!
BW115.緊急出動!神奇寶貝海岸救援隊
BW116.燃燒吧!噴火龍!VS快龍!(小智的噴火龍歸隊,轟隆雉雞寄放在大木研究所)
BW117.電漿團的野心!被操縱的神奇寶貝!
BW118.N的秘密…在霧的遠方!
BW119.火箭隊對電漿團!喵喵與阿克羅瑪!
BW120.白色遺跡!小智對N!
BW121.電漿團襲擊!復活的儀式!
BW122.雷希拉姆對N!理想和真實的那壹方!!
BW123.再見了合眾!新的乘船之旅!(小智在紅豆杉研究所的神奇寶貝被送回大木研究所)
BW124.甘甜蜂蜜充滿危險!
BW125.酒侍偵探天桐!大海原的密室!
BW126.再見水水獺!?通往扇貝貝王之道
BW127.幻影之島!霧中的索羅亞克!!
BW128.洛托姆VS大木博士!
BW129.德科羅拉群島的海賊王!
BW130.小智與巴大蝴!直到再會的那壹天!!
BW131.小智與艾莉絲絕交!? 離別的道路
BW132.向基拉祈許願吧!七日間的奇跡!!
BW133.發光的飛碟!大宇怪之城!!
BW134.大堇登場!エリキテル與ゴーゴート!!
BW135.寶藏之謎!無人島冒險!
BW136.小樁與艾莉絲!異色的赤面龍!
BW137.オンバーン登場!彗星與勇者的傳說!!(8月15日)
BW138.Go Go ゴーゴート!(8月22日)
BW139.導電飛鼠,加入火箭隊!(9月5日)
BW140.天桐VS冰之挑戰者 三曜道館的危機!(9月12日)
BW141超級願望!直到再會的那壹天!!
BW142我的夢想、神奇寶貝大師!!
真實集數壹***只有142集,
因東日本大地震的海嘯和核泄漏事故,部分原定播出內容受影響。原第23、24集的《火箭隊VS等離子團團!(前、後篇)》不再播出(在N篇章重新演繹),原26集的《釣魚酒侍!天桐登場!!》延遲在原BW39(現BW36)之後播出,內容也有少許改動,所以變成BW37。因上述原因,集數編號不能與網上視頻對應,所以請自行增加集數2或3集,然後再觀看。本排法是根據日本神奇寶貝官網公布的官方排法,請勿自行修改。
本部的播出進程中,也播出過《神奇寶貝鉆石&珍珠》的特別篇,但由於並不屬於超級願望篇,因此沒有計入本部集數。
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