高考成績
2012年，南航附中純文化類文理科本二以上上線人數達199人（不含藝術類），列居白下區第壹。宋歡以380分的成績列白下第壹，成為全區理科狀元。***51名參考學生有49名達本二錄取線。
2014年，該屆學員以409分和391分的成績摘得南京市理科桂冠和文科桂冠。南航附中高中部達文化本二線281人，本科及以上達線達級率96.8%。
專項競賽
2010屆高三郭放同學在南航大組織的首屆中學生“My.Minicar”概念車設計大賽中，獲全國第5名。
2011屆高三曹先然同學DIY了壹個“方舟反應堆”，獲2010年市通用技術作品評比第壹名。
2011屆高三在校生韓傑星獲2010年“恒力杯”江蘇省青少年航空模型競賽P5A—2、P3A—2二級無線電遙控電動特技飛行雙項冠軍。
2012年8月，南京航空航天大學附屬高級中學的航模隊榮獲2012年江蘇省青少年航空模型錦標賽高中組綜合團體第壹名。
體育藝術 2013年，南航附中健美操隊壹舉奪得高中組技巧啦啦操團體壹等獎的第壹名、高中技巧啦啦操自編套路第壹名，高中技巧啦啦操規定套路第壹名、高中花球啦啦操規定動作第壹名，並且再次獲評組委會頒發的“體育道德風尚獎”。 張恩懷，江蘇省高中英語特級教師，曾獲得安徽省勞動模範、江蘇省優秀教育工作者等榮譽稱號，是南京市“斯霞獎”獲得者。
黃智華，江蘇省高中數學特級教師，曾獲得江蘇省優秀教育工作者、南京市學科帶頭人等榮譽稱號。
2011年，何中雷、程璐代表南京市參加第壹屆全國中小學體育教師教學技能比賽分別獲取壹等獎、二等獎。 2007年以來，南航附中多次承辦全國班主任大會、全國班主任專業化發展高層論壇等全國重大德育會議，獲得了全國中華民族傳統美德教育百家示範校、全國中小學思想道德建設實踐創新活動先進單位、全國創建“平安校園”示範學校等多項國家級榮譽。
2012年8月14日，在中國航空學會今年舉辦的航空科普教育校本教材評選活動中，南京航空航天大學附屬高級中學自主編輯校本教材《航空航天知識讀本》榮獲全國二等獎。
南京航空航天大學附屬高級中學連續獲得南京市績效評估壹等獎——“綜合管理獎”和“高考成績優秀獎”，“校長教學管理獎”。2013年獲批成為白下區首家可招收指標生的四星級高中。
南航附中獲全國中小學思想道德建設活動先進單位、江蘇省文明單位、江蘇省綠色學校、江蘇省平安校園等榮譽稱號，是南京市”十二·五”首批“教科研基地學校“、南京市“星光基地學校”、南京市“青奧示範校”。