1、音樂治療的物理作用：大腦皮層上的聽覺中樞與痛覺中樞的位置相鄰，因此通過音樂刺激造成大腦聽覺中樞的興奮就能有效地抑制相鄰的痛覺中樞，提高大腦的興奮程度，經神經和體液的調節，促進人體分泌有利於健康的激素或神經介質，從而達到調節血液循環、加強人體新陳代謝、清除疲勞、對抗抑郁、焦慮及其他心理危機的發生，緩解、減輕心理疾病癥狀直至康復的目的。
2、音樂治療的生理作用：音樂可以引起各種生理特征（呼吸、心跳、血壓的高低、皮膚溫度、皮膚電阻值降、肌肉電位、血液中的去甲腎上腺素含量等）的改變，進而明顯地促進人體的內部機能穩定，減少緊張焦慮情緒，使治療者恢復平靜。
3、音樂治療的社會作用：音樂活動如樂器合奏、合唱、音樂遊戲、舞蹈等，本身就是壹種社會交往活動。通過組織各種音樂活動，為心理疾病患者提供壹個用音樂和語言交流來表達、宣泄內心情感的機會，讓病人在情感交流中相互同情、理解和支持。這樣，治療者在各種心理困擾和痛苦得到緩解的同時，也獲得到了自我表現和成功感的滿足，從而使其增加自信心，提高自我評價，促進心理健康。
4、音樂治療的心理作用：美國著名心理學家阿諾德認為：如果壹個人的情緒出現了問題，他的頭腦中就壹定會存在某些不合理觀念。如果這種不合理觀念得到糾正，情緒問題也就隨之解決。傳統的心理治療認為認知決定情緒，而音樂心理治療則認為情緒決定認知。音樂對於人情緒的影響力是非常巨大的，當壹個人的情緒好的時候，往往看到事物的積極方面，把壞事看成好事；反之，當壹個人的情緒不好的時候，往往看到事物的消極方面，把好事看成壞事。因此只要情緒改變了，人對問題的看法也會有相應的改變。