第壹部《沙丘》分為三卷。第壹卷《沙丘》講述了帕迪沙皇帝依靠古老的帝國制度統治著整個銀河帝國。相比之下，有兩股強大的力量，即壟斷了航天運輸業的航天工會和分布在銀河系的相對獨立的王子和大公。
皇帝害怕勒托公爵崔迪，派他到遙遠的烏拉科斯，試圖殺死公爵。勒托公爵來到伊拉科斯，哈卡南領主弗拉基米爾在這裏盤踞多年，掠奪香料，聚斂大量財富？哈科南男爵不想放棄巨額利潤，此外，他與勒托公爵有血海深仇。於是男爵在黑暗中鍛造了壹把陰謀之劍，準備攻擊尚未站穩腳跟的公爵。
另壹方面，公爵的兒子保羅和聖母學院預測的薩茨·亞德裏克的先知傑西卡·貝尼斯(Jessica Benice)從他的母親那裏接受了“講真話”和戰鬥訓練。傑西卡能準確識別人們是否在說謊，或通過講真話用心理暗示指揮他人。
保羅通過了聖母瑪利亞的考驗，帶著家人和軍隊來到了以拉哥斯。他幫助父親處理事務，迅速成長。公爵救出了沙丘星球上被巨型陸生蠕蟲攻擊的采石場工人，以及他的下屬“明塔特”刺客杜菲？哈瓦特和外交官鄧肯逐漸認識了埃拉科斯的弗裏曼土著人，希望與他們合作對抗哈卡納人。
在男爵突襲公爵的當晚，皇帝的衛隊“薩多卡”配合哈可南的軍隊圍攻公爵。嶽醫生，那個間諜，放了傑西卡和保羅。嶽大夫降服了公爵，打算和男爵做壹筆交易，交換他的妻子——而男爵僥幸逃脫了。公爵的遺孀傑西卡和保羅壹起逃到了沙漠。保羅後來知道他的母親其實是壹個男爵的女兒。他冷冷地變成了自由人傳說中的先知和救世主摩阿迪巴，在收集父親權杖的路上尋仇。？
第二卷《摩阿迪巴》。保羅和他的母親傑西卡在沙漠中逃亡，他們遇到了行星生態學家凱恩斯和弗裏曼。當哈科南人來追捕他們時，他們獻出了生命來保護這對母子。當他們來到弗裏曼的領地時，保羅和他的母親說服了部落首領史泰格，保羅在壹場決鬥中殺死了壹名不服氣的弗裏曼戰士，在部落考驗和儀式完成後，他們分別成為了先知穆阿迪布和薩雅迪納的聖母。後來，保羅娶了凱恩斯的女兒切尼，開始發展自己的權力。
哈科南男爵最喜歡的繼承人菲德爾·羅薩在杜菲，他認為自己被傑西卡背叛了？在哈瓦特的幫助下，他獲得了很高的聲譽，並努力實現自己的抱負。此外，哈科南男爵和帝國使者芬倫伯爵在交談中暴露了他們的不信任。哈科南人試圖取代皇帝，皇帝對男爵壹直很警惕。
第三卷《先知》。菲德爾·羅薩和男爵互相爭奪權力，伊拉科斯的新統治者拉班勒索和屠殺弗裏曼的人民。帕迪沙皇帝的薩多卡軍團也是虎視眈眈，矛盾壹觸即發。傑西卡生下了托雷公爵和保羅的妹妹以利亞的遺腹子，她不僅擁有母親和祖先的記憶，還擁有像保羅壹樣的遠見卓識。保羅成為了弗裏曼人的領袖，同時學會了控制蠕蟲的技能，聲望如日中天。
在沙漠中，他找到了他父親的老員工高尼，他已經成了壹名走私犯。哈裏特，弗裏曼的各部在保羅的指揮下集結，沙丘中的反應部隊將掀起壹場巨變。
皇帝帕迪沙聯合各路勢力利用親征伊拉科斯，在壹場風暴中展開了決戰——薩多卡軍大敗，哈克南男爵被伊利亞刺殺，弗裏曼部落大獲全勝，哈瓦特在保羅的懷抱中得救。保羅威脅要毀掉香料，並在決鬥中殺死了弗雷德·羅莎。戰鬥結束後，保羅為了登上王位，平息各方紛爭，正式迎娶伊朗公主。