下面是壹篇文獻介紹。
關於人類基因組 正向選擇信號 的檢測分析。
正向選擇：某壹突變位點逐漸積累，成為優勢的位點。
具體表現為：隨著時間延長，該位點的突變基因型頻率越來越高，遠遠超過野生型；
通過比較 馴化/野生動植物 、 現代智人/靈長類動物 、 特定人群/參考人群 等方式，查找受到正向選擇的基因組。
解釋受到正向選擇的基因組與特定表型的關系。
檢測正向選擇的方法有很多，下面以壹篇文獻為例，為大家介紹怎麽圍繞正向選擇講故事。
文獻來源“ Detecting signatures of positive selection associated with musical aptitude in the human genome ”
研究樣本：283個沒有親緣關系的芬蘭人。
研究表型：將這283個樣本按照音樂能力分為兩部分，case是音樂才能比較高的人，control是沒什麽音樂天賦的。
基因型：Illumina HumanOmniExpress 12 1.0?V SNP chip
正向選擇分析方法：這裏用了haploPS、XP-EHH、 Fst這三個方法掃描正向選擇位點。
在case樣本中P值小於0.05的基因組區域，且在control樣本中，這些顯著基因組區域沒有達到顯著水平。
XP-EHH得分達到top 0.1%的位點作為正向選擇的位點。
Fst值在top 1%的位點作為正向選擇的位點。
生物學功能註釋采用的 Genetrail2 工具（ rail2.bioinf.uni-sb.de/ ）。
生物學功能註釋結果顯示，正向選擇的位點和基因 (DICER1, FGF20, CUX1, SPARC, KIF3A, TGFB3, LGR5, GPR98, PAX8, COL11A1, USH2A, and PROX1) 主要與內耳發育過程有關。
以上就是結合多個自然選擇的工具，闡述正向選擇的基因與表型之間的關系。
當然，不同文獻對這些自然選擇工具的閾值設定會有壹點差別。
今天的文獻解讀就講到這。
所謂借鑒別人的文獻，做自己的分析。
希望各位讀者有所收獲!