結局中沒有給出當麻最後和誰在壹起。
1、當麻與禦阪美琴
當麻與禦阪美琴在本傳故事開始的前壹個月就相識，自從助幫美琴從不良少年的糾纏下結尾開始，便與她結下孽緣。因為他的右手輕易地消除了美琴的絕招，所以經常被美琴找麻煩。本來只是美琴決鬥對象的“令她在意的存在”。
但在“絕對能力者進化計劃”中美琴陷入絕望之際，上條賭上性命阻止了那場實驗，成為了她心中“只要哭喊，就會來救我的英雄”，美琴對他開始微妙起來。不過，對於美琴對他的好意，上條完全沒有察覺，只把她看作是值得信賴的夥伴（直到故事最後）
2、當麻與茵蒂克絲
而當麻遇上茵蒂克絲後，想幫助她而奔走、作戰，記憶喪失後也壹樣。上條起初認為她的好意與信任，是對於喪失記憶之前的他，但是之後就比較不在意了。
雖然在拯救茵蒂克絲的時候被“光之羽”擊中頭部而失去記憶，但上條為了不讓茵蒂克絲感到悲傷，為了守護住少女心中的這份溫暖，繼續扮演失憶前的上條當麻這個角色。
在空中要塞“伯利恒之星”墜落之際，上條向因無人操控而漂浮在遠距控制靈裝周圍、僅以意識存在的茵蒂克絲坦承了失憶的事。在上條眼中，茵蒂克絲就是個成天只會吃吃睡睡看電視的女生，故事中並沒有交代二人的感情是如何發展的。
擴展資料：
劇情簡介——
故事講述的是從東京都西部被分割出來的這座都市中，“超能力開發”被列為學校課程的壹部分。在二百三十萬人口中，有八成都是學生，所以被稱為學園都市。他們每天都在超能力開發上進行相互競爭。根據能力高低不同，可以分為6級，從無能力到超能力。故事的主角上條當麻是學園裏的壹個無能力者，但並非完全沒有能力，他的能力是能夠將壹切異能之力無效化。
他只有右手能夠使用這種能力，還給自己的這種連上帝的奇跡都能抹殺的能力取名為“幻想殺手”。而正因為他的右手似乎把神的祝福都給抹殺掉的緣故，導致自己壹直過著不幸的生活。某壹個暑假的日子，在家裏的陽臺上，
他遇見了壹位修女；這位少女自稱自己的名字叫“茵蒂克絲”，並是從魔法的世界逃了出來，現在正在被魔法師追趕中。就這樣，掌握了十萬三千本究極魔法書的少女與擁有抹殺壹切奇跡的神上之手的少年，將面臨壹系列故事…