巫妖大戰是小說《佛本是道》等現代洪荒流小說中的設定。傳統神話中沒有這個情節，巫妖大戰是洪荒開天辟地後的三大量劫（巫妖大戰、封神之戰、佛道之爭）之壹，是壹場由誇父逐日、大羿射日所引發的曠古絕今的戰爭。
大戰起因
人間界中，祖巫好戰，***工與祝融不知何故在不周山大戰，雙雙身殞，其間***工怒觸不周山，天柱斷，頓時天塌地陷，天火從天而降，天河倒灌，女媧補天，所用的五彩石碎片落於洪荒之中（五彩石實與西遊中孫悟空沒關系。
西遊中孕育孫悟空的石頭為開天辟地壹仙石，但開天辟地之時，天地間依舊是壹片混沌，都尚未有仙，所以叫仙石也是後世說法，準確應該叫混沌石，西遊中稱之為開天辟地壹仙石。
原著中記載：蓋自開天辟地以來，每受天真地秀，日月精華，感之既久，遂有靈通之意。內育仙胞，壹日迸裂，產壹石卵，似圓球樣大。因見風，化作壹個石猴，五官俱備，四肢皆全。所以五彩石跟孫悟空實沒有關系，為電視劇改編。）。
巫族剩余十祖巫（帝江、句芒、蓐收、燭九陰、強良、奢比屍、天昊、弇茲、玄冥、後土）。
帝俊十子犯過天條，十日齊出遊歷太古洪荒大地，生靈塗炭。隨後由於十日齊出死傷無數，大巫誇父不滿，行逐日之事，東皇十子將誇父曬死。
大巫誇父被殺後，大巫大羿大怒，舉部落之力，加以巫族各種秘術，造箭用射日弓射殺九只金烏。
大羿射殺九只金烏後，遭準提算計，被殺死。巫妖雙方矛盾日益激化。東皇第十子陸壓取誇父、大羿精氣於壹葫蘆，是為斬仙飛刀。（後來，在封神壹戰中，東皇第十子化為陸壓道人，大放異彩）
大戰結局：
各教興起
巫妖大戰後人族大興，各個天道聖人遂開派立教。太上老君所創的人教、元始天尊所創的闡教、通天教主所創的截教興起。三清繼承盤古大弟子名號，是為親傳弟子，三清各自所創的人教、闡教、截教合在壹起稱為盤古正宗，也稱玄門，後統稱道教。
接引道人演沙門，立西方教，接引道人即為佛主阿彌陀佛，準提道人則為佛母菩提祖師。女媧的妖族則隨巫妖大戰泯滅（巫妖大戰死傷無數，幸存的妖族中人大部分散落於洪荒星辰之中）。
巫妖大戰後，東皇太壹隕落，天庭無主，鴻鈞立身邊童子（昊天）為天庭玉帝、童女（瑤池）為天庭王母。
以上內容參考：百度百科-巫妖大戰